工商年报员工人数造假，一般由市场监督管理部门进行罚款。以下是对此问题的详细分析：
一、法律责任主体
工商年报是企业向市场监督管理部门提交的重要文件，用于公示企业的基本信息和经营状况。员工人数作为工商年报中的一项重要内容，其真实性直接关系到企业信息的准确性和透明度。如果企业故意在工商年报中造假员工人数，就构成了对市场监督管理部门公示信息的欺骗行为，需要承担相应的法律责任。
二、罚款部门及依据
罚款部门：根据相关法律法规，市场监督管理部门是负责监管企业工商年报真实性的主要部门。因此，当发现企业工商年报中员工人数造假时，市场监督管理部门有权对企业进行罚款。
罚款依据：
- 《企业信息公示暂行条例》：该条例明确规定了企业应当真实、准确、完整地公示其年度报告信息。如果企业违反规定，未按照规定的期限公示年度报告或者未按照市场监督管理部门责令的期限公示有关企业信息的，由县级以上市场监督管理部门列入经营异常名录，并依法给予行政处罚。虽然该条例未直接提及员工人数造假，但造假行为显然违反了“真实、准确、完整”的公示原则。
- 《中华人民共和国市场主体登记管理条例》及其实施细则：这些法规对市场主体的登记、备案、公示等行为进行了详细规定。如果企业违反规定，提交虚假材料或者采取其他欺诈手段隐瞒重要事实，取得市场主体登记的，由登记机关责令改正，没收违法所得，并处5万元以上20万元以下的罚款；情节严重的，吊销营业执照。虽然这些法规主要针对的是市场主体登记行为，但造假员工人数也可以视为一种隐瞒重要事实的行为，市场监督管理部门可以据此进行处罚。
- 地方性法规或规章：部分地区可能根据本地实际情况，制定了更为具体的地方性法规或规章，对工商年报造假行为进行了更为详细的规定和处罚。
三、法律后果及建议
法律后果：企业因工商年报员工人数造假被市场监督管理部门罚款后，不仅需要承担经济上的损失，还可能面临信用受损、业务受限等不利后果。例如，被列入经营异常名录的企业，在政府采购、工程招投标、国有土地出让、授予荣誉称号等方面将受到限制或者禁入。
建议：
- 企业应严格遵守相关法律法规，确保工商年报的真实性和准确性。
- 加强内部管理，建立健全的信息公示制度，防止因人为疏忽或故意造假而引发的法律风险。
- 如遇法律问题，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。
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