针对您提出的“交通事故在医院康复科住院治疗，医药费保险公司能否理赔”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、保险公司通常可以理赔交通事故后的康复治疗费用
在交通事故中，如果受害者因事故导致损伤并需要后续的康复治疗，这部分费用在法律上通常是可以得到支持的。根据《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，医疗费包括因治疗交通事故损伤而产生的合理费用。若康复治疗是因交通事故导致的损伤而必需，且与事故有直接因果关系，同时康复医院具备合法医疗资质，并能提供正规发票和病历等证明材料，那么这部分费用通常会被认定为合理的医疗费用，保险公司应给予报销。
二、理赔的具体条件
康复治疗的必要性和合理性：保险公司会评估康复治疗是否针对交通事故所造成的损伤进行的必要治疗，以及治疗方式、费用是否超出合理范围。
保险合同约定：保险合同是确定赔偿范围的重要依据。您需要仔细阅读保险合同条款，了解保险公司对康复治疗费用的赔偿政策和程序。若合同中明确约定了对因交通事故导致的后续康复治疗费用予以赔偿，且康复治疗符合合同规定的条件，保险公司应按合同约定进行报销。
责任归属：若交通事故是由于被保险人的责任造成的，且保险合同中未排除此类情况下的康复治疗费用，保险公司应根据合同规定进行赔付。
三、可能不予理赔的情形
康复治疗不合理或不必要：如保险公司认为康复治疗并非针对交通事故所造成的损伤进行的必要治疗，或治疗方式、费用超出合理范围，可能会拒绝报销。
不符合保险合同约定：若康复治疗不符合保险合同中的免责条款和理赔条件（如未在指定医疗机构治疗、超过合同约定的时间限制等），保险公司有权拒绝赔偿。
超出保险责任限额：每份保险都有责任限额。若之前的医疗费用及其他赔偿项目已使保险赔偿金额达到责任限额，对于超出部分的康复费用，保险公司将不再承担赔偿责任。
第三方已支付或应承担费用：若肇事方或其他第三方已为受害者支付了康复治疗费用，或根据法律规定应承担这部分费用，保险公司可能会相应减少或不再支付这部分费用。
四、建议与操作流程
仔细阅读保险合同：在治疗前，请务必仔细阅读保险合同条款，了解保险公司的赔偿政策和程序。
保留相关证据：在治疗过程中，请保留好所有相关证据和文件，如正规发票、病历、伤残证明、交通事故责任认定书等。
与保险公司协商：若您认为康复治疗费用应得到赔偿，可以与保险公司进行协商。若协商不成，您可以考虑通过法律途径解决。
咨询专业法律顾问：在需要时，您可以咨询专业的法律顾问或保险代理人，以获取最准确的信息和建议。
综上所述，交通事故后在医院康复科住院治疗的医药费，在符合一定条件下，保险公司是可以理赔的。但具体理赔情况还需根据保险合同约定、康复治疗的必要性和合理性以及责任归属等因素来综合判断。