督办与问责申请书可以合并撰写，但需根据具体场景和目的调整内容结构。以下是分情况说明：

1. 若督办与问责事项存在直接关联

• 可合并撰写：例如，某项目因责任部门拖延导致进度严重滞后，申请督办的同时需追究相关人员责任。此时可将督办要求（如限期整改、提交方案）与问责依据（如制度条款、失职事实）整合在同一份文书中，重点突出因果关系和责任链条。
  
• 注意事项：需明确区分督办内容（如时间节点、任务要求）与问责内容（如责任人、处罚建议），避免逻辑混淆。

2. 若督办与问责事项无直接关联

• 建议分开撰写：例如，督办某政策落实情况，同时需对另一事件中的违规行为问责。此时合并可能削弱文书针对性，分开撰写更利于分别明确诉求和依据。
  
• 例外情况：若上级单位要求统一提交材料，可合并为一份报告，但需通过章节或标题清晰划分督办与问责部分。

3. 实务操作建议

• 形式选择：合并时建议采用“分点论述+附件”形式，如主文阐述督办事项，附件列明问责依据及建议；分开时需注意两份文书的编号、签发单位等格式统一性。
  
• 法律依据：需引用具体制度条款（如《公务员法》《行政机关公务员处分条例》）支撑问责部分，督办部分则需引用任务来源文件（如会议纪要、领导批示）。

如有具体案例或文书模板需求，可直接向我提供背景信息，我将进一步协助完善内容。