原配起诉小三并申请冻结其银行账户，一般不会对原配的银行账户产生影响，但可能影响到小三的财产权益。下面我对此进行详细分析：

一. 原配起诉小三的法律后果

1. 重婚罪的适用：如果小三与原配配偶存在重婚行为，即小三明知对方有配偶而与之结婚，或者原配配偶在有配偶的情况下与小三结婚，那么根据《中华人民共和国刑法》第二百五十八条，小三和原配配偶都可能面临二年以下有期徒刑或者拘役的刑罚。但这与原配的银行账户无关。

2. 财产纠纷的处理：原配起诉小三可能涉及财产纠纷，如要求小三返还因不正当关系获得的财产等。在这种情况下，原配可能会申请法院冻结小三的银行账户以确保判决的执行。这种冻结措施是针对小三的，不会影响到原配的银行账户。

二. 冻结银行账户的影响

1. 对小三的影响：如果法院裁定冻结小三的银行账户，那么小三将无法使用该账户内的资金，直到法院作出进一步裁定或判决执行完毕。这可能对小三的日常生活和经营活动产生较大影响。

2. 对原配的影响：原配作为申请人，其银行账户通常不会因申请冻结小三的银行账户而受到影响。除非原配与小三存在共同的财产或债务关系，且该关系被法院认定需要一并处理，否则原配的财产权益不会因起诉和冻结行为而受损。

我的观点：原配起诉小三并申请冻结其银行账户，主要是为了保护自己的财产权益和确保判决的执行。这一行为通常不会对原配的银行账户产生影响，但可能会对小三的财产权益造成较大影响。如有进一步需要，您可以继续咨询我。