在民事合同纠纷中起诉县政府部门时，是否可以将县政府列为共同被告，需根据具体情况分析，结论如下：

1. 若县政府部门以自身名义签订合同并独立承担责任，县政府通常不列为共同被告
   根据《民法典》第四百六十五条，合同仅对签订主体产生约束力。若合同由县交通局、住建局等具体部门以自身名义签订，且合同权利义务由该部门独立承担（如合同条款明确约定“由某局承担付款义务”），则县政府作为上级机关，一般无需承担连带责任。此时，原告应以签订合同的部门为被告。

2. 若县政府部门以县政府名义签订合同，或合同履行涉及县政府决策，县政府可能被列为共同被告
   根据《民法典》第一百七十条，法定代表人或授权代表以法人名义从事的民事活动，由法人承担法律后果。若合同抬头为“XX县人民政府”，或合同履行需县政府审批、拨款（如财政资金支付），则可能构成“表见代理”或“职务行为”，此时县政府需作为共同被告参与诉讼。例如，某县住建局签订的道路建设合同中约定“付款需经县政府财政审批”，则县政府可能因合同履行与部门存在关联而被列为共同被告。

3. 若县政府部门行为超出职权范围，县政府可能因监督失职被追加为共同被告
   根据《行政诉讼法》第二十六条，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，作出行政行为的行政机关是被告。但若县政府部门在签订合同中存在越权行为（如无权处分国有资产），且县政府未履行监督职责导致损失扩大，原告可依据《国家赔偿法》第七条，以县政府为共同被告主张连带赔偿责任。例如，某县环保局未经批准签订排污设备采购合同，导致财政资金损失，县政府可能因未履行监管职责被追加为被告。

法律建议：

• 证据收集：需重点收集合同文本、付款凭证、政府会议纪要等材料，证明县政府与合同履行的关联性。
  
• 程序选择：若主张县政府承担责任，需在起诉时明确列为共同被告，避免后续追加被告的程序风险。
  
• 风险评估：若县政府被列为被告，案件可能涉及行政诉讼与民事诉讼交叉问题，需提前制定诉讼策略。
  

进一步行动：
若您手头有合同文本、政府文件等关键材料，可直接向我提供具体案情，我将结合证据进一步分析县政府是否需承担责任。