三方协议中，若公司法人未签字，该协议是否有效需分情况讨论：

1. 若公司已加盖公章，则协议有效

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，公司作为法人，其民事行为能力通过法定代表人或授权代表行使，但公司公章是公司对外作出意思表示的重要凭证，具有法律效力。
   • 在三方协议中，若公司已加盖公章，即使法定代表人未签字，也视为公司已对该协议内容予以确认，协议因此具有法律效力。这是因为公章的加盖代表了公司的意志，对外具有公示公信力。

2. 若公司未加盖公章，且无法定代表人签字或授权代表签字，则协议可能无效

   • 在没有公司公章且无法定代表人或授权代表签字的情况下，协议可能因缺乏公司有效意思表示而无效。因为此时无法证明协议内容已得到公司的认可或授权。
   • 当然，如果存在其他证据（如公司内部文件、会议纪要等）能够证明公司对协议内容予以确认，或者相对方有理由相信签字人有权代表公司签字（如表见代理），则协议仍可能被认定为有效。但这种情况较为特殊，需要具体证据支持。

法律建议：

• 对于公司而言，在签署三方协议等重要文件时，应确保公司公章的加盖或法定代表人的签字，以避免因形式要件缺失而导致的法律风险。
• 对于相对方而言，在签署协议前应核实签字人的身份和授权情况，必要时可要求公司提供相关证明文件，以确保协议的有效性。

可能法律后果：

• 若协议因形式要件缺失而被认定为无效，则双方可能无法依据协议内容主张权利或履行义务，可能导致合同目的无法实现，甚至引发纠纷和损失。
• 因此，在签署三方协议时，双方应严格遵守法律规定和合同约定，确保协议的形式和内容均符合法律要求。

如有其他公司法务方面的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。