借款合同代偿是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律依据
根据《民法典》第五百二十四条的规定：“债务人不履行债务，第三人对履行该债务具有合法利益的，第三人有权向债权人代为履行；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定只能由债务人履行的除外。债权人接受第三人履行后，其对债务人的债权转让给第三人，但是债务人和第三人另有约定的除外。” 这一条款明确赋予了第三人在特定条件下代为清偿债务的权利，因此，借款合同代偿在法律上是得到认可的。
二、代偿的合法情形
债务人同意：如果债务人明确同意由第三人代为清偿债务，那么这种代偿行为无疑是合法的。在这种情况下，第三人代为清偿后，债权人对债务人的债权将依法转让给第三人。
保证人代偿：在借款合同中，如果存在保证人，并且保证合同中明确约定了保证人在债务人未能履行债务时有权代为清偿，那么保证人的代偿行为也是合法的。
债权人接受：即使债务人没有明确同意，但如果债权人在未与债务人达成明确协议的情况下接受了第三人的代偿债务，那么在一定程度上，债务人所欠的既有债务便会在已清偿的范围内自动消灭。不过，为了避免后续纠纷，建议在这种情况下，第三人、债务人和债权人最好能就代偿事宜达成书面协议。
三、代偿的注意事项
代偿协议：为了确保各方权益能够公平有序地得到维护，代偿协议的确立往往需要得到债务人本人的确认及同意。这有助于明确各方的权利义务，避免后续纠纷。
代偿范围：第三人代为清偿的债务范围应当明确，避免因为代偿范围不清而产生争议。
法律后果：如果第三人未经债务人同意擅自代偿，并且代偿行为存在违法违规情节（如通过代偿非法转移财产等），则可能产生法律责任。因此，第三人在代偿前应当充分了解相关法律法规，确保自己的代偿行为合法合规。
四、实际案例
在实际生活中，借款合同代偿的案例并不少见。例如，在某些情况下，债务人可能因为资金周转困难而无法按时偿还借款。此时，如果有一个对债务人具有合法利益的第三人（如债务人的亲友或关联企业）愿意代为清偿债务，并且得到了债权人的接受，那么这种代偿行为就是合法的。代偿后，债权人对债务人的债权将依法转让给第三人，债务人则免除了相应的债务责任。
借款合同代偿是合法的，但需要满足一定的条件。如果您在借款合同代偿方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。