最高法院追讨违约金确实存在诉讼时效的限制。以下是对这一问题的详细分析：

一、诉讼时效的基本规定

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于追讨违约金的情形。具体来说，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

二、诉讼时效的中断与重新计算

在诉讼时效期间内，如果债权人向债务人主张过权利，比如通过书面、口头等方式要求支付违约金，那么诉讼时效会中断，并从中断时起重新计算三年。这一规定有助于保护债权人的合法权益，防止因债务人拖延或逃避而导致的权利失效。

三、最长权利保护期间

除了三年的普通诉讼时效期间外，法律还规定了最长权利保护期间。自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院一般不予保护。但是，如果有特殊情况，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。这一规定旨在平衡债权人和债务人的利益，防止因时间过长而导致的证据灭失或记忆模糊等问题。

四、诉讼时效届满后的法律后果

如果诉讼时效届满后，债务人自愿履行支付违约金义务的，事后不得以诉讼时效届满为由要求返还。这一规定体现了法律对债务人自愿履行行为的尊重和保护。

五、实际操作中的建议

1. 及时主张权利：债权人应在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内及时主张权利，避免因诉讼时效届满而导致的权利失效。
2. 保留证据：在主张权利的过程中，债权人应保留好相关证据，如书面通知、聊天记录等，以证明自己在诉讼时效期间内已经主张过权利。
3. 咨询专业律师：如果债权人对诉讼时效问题存在疑问或不确定如何操作，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。

总结来看，最高法院追讨违约金确实存在诉讼时效的限制。债权人应在法定诉讼时效期间内积极主张权利，并保留好相关证据以维护自身合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。