在房屋租赁合同中，约定“租赁相关税费由乙方承担”的条款，在不违反法律、行政法规强制性规定及不违背公序良俗的前提下，是合法有效的。以下是对这一问题的详细分析：
合法性依据
合同自由原则：根据我国《民法典》等相关法律法规，民事主体享有合同自由权，可以在平等、自愿、协商一致的基础上，通过合同自由约定双方的权利和义务。因此，租赁合同中关于税费承担的约定，只要双方意思表示真实且内容合法，即具有法律效力。
税收法定原则的例外：虽然税法对于各项税种的纳税义务人通常有明确规定，但并不禁止纳税义务人与合同相对方通过合同约定，由另一方实际承担缴纳税款的费用。这意味着，只要合同双方的约定不违反法律强制性规定，且意思表示真实，乙方承担租赁相关税费是可以被法律所认可的。
具体影响与注意事项
乙方责任：
- 乙方需承担因房屋租赁所产生的全部或部分税费，包括但不限于增值税、房产税、个人所得税等。
- 在签订合同时，乙方应充分了解税费的具体范围和计算方式，并考虑这部分额外成本。
- 乙方应保留好税费缴纳的凭证和记录，以备日后可能出现的争议或纠纷中作为证据使用。
甲方义务：
- 尽管税费可能由乙方承担，但甲方作为房屋出租行为的纳税义务人，仍负有纳税申报等法定义务。
- 甲方需按照税务机关的要求进行纳税申报，并提供相应的资料。
- 甲方应确保税费的缴纳符合当地税务机关的要求和程序，不能因约定而逃避其作为纳税主体的责任。
税务合规性：
- 双方的约定必须遵守国家税收相关法律法规的规定，不得通过不合理的约定来逃避或减少应纳税额。
- 如对税费承担有疑问或不确定，建议咨询专业的税务机构或律师进行解答和指导。
合同条款的明确性：
- 为避免纠纷，合同中应清晰明确地表述“租赁相关税费”具体涵盖哪些税种。
- 应明确税费的计算依据、缴纳时间和方式等内容，例如：“本合同项下房屋租赁产生的所有相关税费均由乙方承担，乙方应在接到甲方通知后[X]个工作日内，按税务机关核定的金额缴纳至指定账户。”
可能的法律后果
- 如果双方在租赁合同中明确约定了由乙方承担全部或部分租赁相关税费，并且这一约定符合当地的法律法规和税收政策，那么乙方应当按照合同约定履行缴税义务。
- 如果合同中没有明确约定或者约定违反了法律法规和税收政策，乙方就没有义务承担这些税费。此时，出租人试图将税费转嫁给乙方可能会构成违约行为，乙方有权拒绝并寻求法律救济。
操作建议
- 在签订房屋租赁合同前，双方应充分了解当地的税收政策，并在合同中明确约定税费的承担方式和责任主体。
- 如遇争议或不确定的情况，建议直接向我咨询以获取准确的法律意见和指导。
综上所述，租赁相关税费由乙方承担在法律上可以是合法的，但前提是必须符合相关法律法规和税收政策的规定，并且是基于双方真实意思表示的合同约定。