若男方怀疑孩子非亲生且女方拒绝配合鉴定，男方可通过向法院提起诉讼并提供必要证据来请求确认或否认亲子关系，法院可依据相关证据规则进行推定。
一. 分析说明
亲子鉴定的提起：
- 根据《民法典》第1073条第一款，对亲子关系有异议且有正当理由的，父或母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。这是男方提起诉讼的直接法律依据。
必要证据的提供：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释(一)》第三十九条第一款，父或母向人民法院起诉请求否认亲子关系，并已提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定否认亲子关系一方的主张成立。这表明，男方需要提供初步的必要证据来支持其主张。
法院的推定：
- 即使女方拒绝配合进行亲子鉴定，法院也可以根据男方提供的证据，结合案件的具体情况，进行亲子关系的推定。如果男方提供的证据充分，且女方无法提供相反证据，法院可以直接推定亲子关系不存在。
二. 处理流程
收集证据：
- 男方应首先尝试私下收集一些初步的证据，如孩子的血型、外貌特征等，这些可能间接支持其怀疑。更重要的是，男方可以尝试进行个人委托的亲子鉴定，虽然这种鉴定不能作为法庭上的定案证据，但可以作为提起司法鉴定申请的一种依据。
提起诉讼：
- 在收集到足够证据后，男方应向人民法院提起诉讼，请求确认或否认亲子关系。在诉讼过程中，男方应向法院提交其收集的所有证据，并详细说明其怀疑的理由和依据。
法院审理与推定：
- 法院将审理男方的诉讼请求，并综合考虑男方提供的证据、女方的答辩以及案件的具体情况。如果男方提供的证据充分且女方无法提供相反证据，法院将依据相关证据规则进行推定，可能认定亲子关系不存在。
三. 结论与建议
- 结论：在怀疑孩子非亲生且女方拒绝配合鉴定的情况下，男方可以通过向法院提起诉讼并提供必要证据来请求确认或否认亲子关系。法院将依据相关证据规则进行审理和推定。
- 建议：男方在提起诉讼前应充分收集证据，并咨询专业律师以了解具体的法律程序和诉讼策略。同时，男方也应保持冷静和理性，避免对女方和孩子造成不必要的伤害。如有进一步需要，您可以继续咨询我。