房屋计税价格高于实际成交价格，在特定情况下是有法律依据的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与计税原则

根据《中华人民共和国契税法》及相关税收规定，契税的计税依据通常为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格。这包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。然而，在特定情况下，税务机关有权对计税价格进行调整。

二、税务机关调整计税价格的情形

1. 成交价格明显偏低且无正当理由：

   • 如果纳税人申报的成交价格明显低于市场价格，且无法提供合理的解释或证明，税务机关有权依照《中华人民共和国税收征收管理法》的规定进行核定。这种情况下，计税价格可能会高于实际成交价格。

2. 无偿赠与或没有价格的转移行为：

   • 对于土地使用权赠与、房屋赠与以及其他没有价格的转移土地、房屋权属行为，税务机关会参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格依法核定计税价格。这种情况下，计税价格也可能高于实际成交价格（如果实际成交价格为零或极低）。

三、具体案例与解释

以江苏省12366中心的答复为例，他们明确指出了契税计税价格的确定原则，并强调了税务机关在特定情况下的核定权。这实际上为房屋计税价格高于实际成交价格提供了法律依据。例如，在房屋买卖中，如果买卖双方通过某种方式（如虚假报价、隐瞒真实交易情况等）试图降低计税价格，而税务机关在审核过程中发现这一问题，就有权按照市场价格或合理价格进行核定，从而导致计税价格高于实际成交价格。

四、法律建议与后果

• 法律建议：对于纳税人而言，应当如实申报成交价格，并提供相关证明材料。如果认为税务机关核定的计税价格不合理，可以依法提出异议并申请复核。
• 法律后果：如果纳税人故意隐瞒真实交易情况或提供虚假材料以降低计税价格，一旦被税务机关发现，将面临补缴税款、加收滞纳金甚至罚款等法律后果。

总结：房屋计税价格高于实际成交价格在特定情况下是有法律依据的，主要发生在成交价格明显偏低且无正当理由或无偿赠与等没有价格的转移行为中。纳税人应当遵守相关税收规定，如实申报成交价格，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。