结论前置：在农村建一层自住房时，试图通过“安全事故免责协议”来完全免除责任是不合法且无效的，但可以通过合法合规的合同条款来明确双方责任、降低风险。以下是一些建议和合同要点。

1. 免责协议的无效性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，违反法律、行政法规的强制性规定或者违背公序良俗的民事法律行为是无效的。试图通过协议完全免除因施工导致的安全事故责任，很可能被视为无效条款。
   • 特别是当包工头或施工方存在过错（如未遵守安全规范、使用不合格材料等）导致事故时，免责协议无法成为其逃避法律责任的依据。

2. 合法合规的合同要点：

   • 明确双方身份与资质：合同中应明确包工头（或施工队）的资质情况，包括是否具备相应的建筑施工资质、安全生产许可证等。
   • 施工范围与标准：详细描述施工的具体范围、使用的材料标准、施工工艺要求等，确保施工符合安全规范。
   • 安全责任条款：
     • 明确双方在施工过程中的安全责任，如施工方应遵守的安全操作规程、配备必要的安全防护设施等。
     • 约定因施工方原因导致的安全事故，施工方应承担的赔偿责任，包括但不限于医疗费、误工费、财产损失等。
     • 对于不可抗力或第三方原因导致的事故，也应明确责任划分原则。
   • 保险条款：建议施工方购买建筑工程一切险或第三方责任险，以分散风险。合同中可约定保险的购买、理赔等事宜。
   • 违约责任与争议解决：明确双方违约时的责任承担方式，以及争议解决的方式（如协商、调解、仲裁或诉讼）。

3. 实际操作建议：

   • 不要试图完全免责：认识到完全免责的协议在法律上是无效的，转而通过合法合规的合同条款来明确责任、降低风险。
   • 咨询专业人士：在起草合同前，最好咨询有经验的律师或法律顾问，确保合同内容合法、有效。
   • 保留证据：施工过程中，注意保留相关证据（如施工记录、照片、视频等），以便在发生争议时提供证明。

示例合同条款（非完整合同）：

“…第五条 安全责任

1. 施工方应严格遵守国家及地方有关建筑施工安全的法律法规，确保施工过程中的安全。
2. 因施工方原因导致的安全事故，施工方应承担全部责任，并赔偿因此给发包方造成的全部损失。
3. 施工方应为其施工人员购买工伤保险，并承担施工过程中的一切安全风险。 …”

请记住，每个具体情况都可能有所不同，因此在起草和签订合同前，最好根据实际情况咨询专业律师。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。