当案件已过诉讼时效且被告缺席时，法院的判决会依据一系列法律原则和案件具体情况来作出。以下是对这一问题的详细解答：

一、诉讼时效已过的法律影响

诉讼时效主要是针对请求权的抗辩制度。当诉讼时效期间届满，义务人（即被告）将获得诉讼时效抗辩权。这意味着，如果被告在诉讼中提出诉讼时效抗辩，并且这一抗辩被法院查明属实，那么原告（即债权人）可能会丧失通过诉讼程序强制被告履行义务的胜诉权。但需要注意的是，诉讼时效的届满并不导致权利本身的消灭，只是使权利人失去了法律上的强制保护。

二、缺席判决的法律原则

缺席判决是指在一方当事人无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭的情况下，法院依法作出的判决。缺席判决的作出并不依赖于诉讼时效是否已过，而是基于当事人是否履行了到庭参加诉讼的义务。因此，即使诉讼时效已过，只要符合缺席判决的法定情形（如被告经传票传唤无正当理由拒不到庭），法院仍然可以作出缺席判决。

三、已过诉讼时效且被告缺席时的判决

1. 原告证据充分且被告未抗辩：

   • 如果原告能够提供充分的证据来证明其主张的事实，并且被告在缺席的情况下未提出诉讼时效抗辩，那么法院可能会根据原告提供的证据和事实情况，支持原告的诉讼请求。

2. 被告缺席但之前书面提出抗辩：

   • 如果被告虽然缺席，但在之前提交的书面材料中明确提出了诉讼时效抗辩，并且法院在审查后认定诉讼时效确实已过，那么法院将会驳回原告的诉讼请求。

3. 法院的审查义务：

   • 无论被告是否缺席，法院都有义务对案件事实进行审查。这包括审查原告提供的证据是否充分、被告是否提出了有效的抗辩等。在查明事实的基础上，法院将依法作出判决。

四、建议与注意事项

• 及时行使权利：为了避免因诉讼时效问题导致权益受损，建议权利人及时行使权利，不要拖延至诉讼时效期间届满。
• 灵活应对诉讼：在诉讼中，要根据实际情况灵活应对。如果被告提出诉讼时效抗辩，要准备充分的证据来反驳或证明诉讼时效存在中断、中止等情形。
• 寻求专业帮助：如果对于诉讼时效或缺席判决等问题存在疑问，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。

综上所述，已过诉讼时效且被告缺席时，法院的判决将取决于原告提供的证据是否充分以及被告是否提出了有效的诉讼时效抗辩。因此，在处理此类案件时，需要仔细分析案件事实和法律原则，以作出合理的判断和决策。