淘宝扣除保证金是否合法，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同约定是判断的关键

• 根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。淘宝与卖家之间关于保证金的约定，通常会在双方签订的合同中明确。
• 如果合同中明确规定了扣除保证金的条件和情形，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么淘宝在符合合同约定的情况下扣除保证金是合法的。

二. 违约与扣除保证金的合法性

• 根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
• 如果卖家存在违约行为，且合同中有关于违约时扣除保证金的约定，那么淘宝扣除保证金作为违约责任的承担方式之一，是合法的。

三. 保证金性质的影响

• 保证金在合同中通常被设定为一种担保方式，以确保卖家能够履行合同义务。
• 如果保证金被明确约定为定金，且符合《中华人民共和国民法典》第五百八十六条关于定金的规定，那么在其后卖家违约时，淘宝按照合同约定扣除保证金（定金）是合法的。

四. 无法定或约定依据的扣除是非法的

• 如果淘宝在没有合同约定或法律依据的情况下擅自扣除保证金，那么这种行为是非法的，卖家有权要求返还。

综上所述，淘宝扣除保证金是否合法，主要取决于双方合同的约定以及卖家的行为是否构成违约。如果合同中有明确约定，且卖家确实存在违约行为，那么淘宝扣除保证金是合法的。如果无此约定或卖家未违约，淘宝擅自扣除保证金则是非法的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。