可以明确的是，土地承包合同非法变更后并颁证，通过民事诉讼有可能解决，但需分情况讨论：

1. 若争议焦点为合同变更的效力
   若土地承包合同的变更未遵循法定程序（如未经发包方同意、未签订书面变更协议等），导致合同变更无效，承包方可依据《民法典》合同编相关规定，通过民事诉讼主张变更无效，要求恢复原合同效力或赔偿损失。此时，民事诉讼是解决合同效力争议的直接途径。

2. 若争议涉及行政颁证行为的合法性
   若土地承包经营权证已由行政机关颁发，但颁证依据的合同变更存在非法情形（如伪造材料、违反法定程序等），承包方需分两步处理：

   • 第一步：先通过行政诉讼撤销颁证行为。根据《行政诉讼法》，行政机关的颁证行为属于具体行政行为，若其依据的合同变更非法，颁证行为可能被认定为违法，法院可判决撤销或确认无效。
     
   • 第二步：若行政诉讼后合同变更仍被认定为无效，承包方可再通过民事诉讼主张合同权利（如恢复承包地、赔偿损失等）。
     例外情形：若承包方仅要求确认合同变更无效而不涉及颁证行为，可直接提起民事诉讼，无需先行行政诉讼。

3. 若争议涉及第三方权益
   若非法变更合同后，土地已流转给第三方（如转包、入股等），承包方需根据《农村土地承包法》及相关司法解释，结合第三方是否善意取得（如是否支付合理对价、是否知情）等因素，通过民事诉讼主张权利。若第三方非善意，承包方可要求返还土地；若第三方善意，承包方可能仅能主张赔偿损失。

行动建议：

• 立即收集证据（如原合同、变更协议、颁证材料、沟通记录等），证明合同变更存在非法情形（如未履行法定程序、伪造签字等）。
  
• 根据争议焦点选择诉讼路径：若主要争议为合同效力，直接提起民事诉讼；若涉及颁证行为合法性，优先提起行政诉讼。
  
• 诉讼时效需注意：民事诉讼一般时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算；行政诉讼时效为6个月，自知道或应当知道行政行为作出之日起计算。

风险提示：

• 若未及时主张权利，可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
  
• 若土地已流转给第三方且第三方善意取得，承包方可能无法直接收回土地，仅能主张赔偿。
  

如有进一步证据或细节需分析，可直接向我咨询。