工程项目违标串标行为的处理部门，需根据项目性质、行业领域及行为性质，由相应的行政主管部门或司法机关负责。具体分析如下：

一、行政主管部门管辖

1. 住房城乡建设主管部门：

   • 县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门，对本行政区域内工程建设项目招投标活动中的围标串标行为有管辖权。
   • 它们可依照相关法规，对这类违规行为进行调查和处罚，以保障工程建设领域招投标的公平公正。

2. 有关行政监督部门：

   • 对于依法必须招标的项目，由相关行政监督部门负责监督与查处。
   • 不同行业有不同的主管部门，例如：
     • 政府采购项目：由财政部门管辖，财政部门会对采购过程中的围标串标行为进行监管。
     • 交通工程建设项目：招投标则由交通运输主管部门管辖，确保交通领域招投标活动规范进行。

二、司法机关管辖

• 若围标串标行为构成犯罪，会依法移送司法机关追究刑事责任。
• 由犯罪行为发生地等有管辖权的司法机关进行管辖，司法机关将依据法律规定，对犯罪嫌疑人进行审判和处罚。

三、投诉与举报途径

• 根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第六十条，投标人或者其他利害关系人认为招标投标活动不符合法律、行政法规规定的，可以自知道或者应当知道之日起10日内向有关行政监督部门投诉。
• 投诉时应当有明确的请求和必要的证明材料，以便行政监督部门进行调查和处理。
• 此外，一些地区会开展打击整治围标串标的专项行动，并公开征集问题线索。例如，赣州市南康区就曾发布过相关公告，明确了整治范围、重点以及受理方式。

四、实际案例分析

• 以某交通工程建设项目为例，若投标人私下商定通过互相抬高或压低报价等方式进行围标串标，以确保某公司中标，且此行为在项目招投标活动进行时被发现。
• 在此情况下，若该项目属于交通运输主管部门管辖范围，则应由交通运输主管部门负责处理该围标串标行为。
• 若该行为构成犯罪，则将依法移送犯罪行为发生地等有管辖权的司法机关，由司法机关追究其刑事责任。

建议：在遇到工程项目违标串标问题时，首先应明确项目性质、行业领域及行为性质，以便确定正确的处理部门。同时，保留好相关证据材料，以便在投诉或举报时提供有力支持。若您在工程项目违标串标方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。