已建成的永久工程损坏损失，如系不可抗力导致，则通常根据合同约定或法律规定，由相应责任方承担，可能涉及免责或部分免责。具体分析如下：
一. 不可抗力导致的损失承担
法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百九十条，当事人一方因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但是法律另有规定的除外。这表明，如果已建成的永久工程损坏是由于不可抗力（如自然灾害）造成的，那么责任方可能根据不可抗力的影响程度，被部分或全部免除赔偿责任。
实际应用：在实际情况中，如果工程损坏是由于地震、洪水等不可抗力因素导致的，那么损失承担问题通常需要依据合同条款和法律规定来确定。如果合同中明确规定了不可抗力条款，且损失确实由不可抗力造成，那么责任方可以依据合同条款和民法典的相关规定，主张免责或部分免责。
二. 合同约定的责任承担
重要性：除了法律规定外，合同中的约定也是确定损失承担的重要依据。如果合同中明确规定了损失承担的方式和责任方，那么应当优先按照合同约定执行。
实例说明：例如，如果建设合同中约定了因不可抗力导致的损失由发包方承担，那么即使工程损坏是由于不可抗力造成的，承包方也无需承担责任，而是由发包方根据合同约定承担损失。
三. 总结与建议
总结：已建成的永久工程损坏损失由谁承担，需要根据具体情况来判断。如果损失是由不可抗力导致的，且合同中未明确约定损失承担方式，那么可以依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，由责任方根据不可抗力的影响程度，主张免责或部分免责。
建议：在处理此类问题时，建议首先查看合同条款，了解损失承担的具体约定。如果合同未明确约定或存在争议，可以寻求专业法律意见，以确保权益得到妥善保护。如有进一步需要，您可以继续咨询我。