公司民事调解案件在执行中，一般不能直接追加代持股东为被执行人，但在特定情形下，如代持股东未履行出资义务等，可依据相关法律规定申请追加。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：不能直接追加代持股东为被执行人
在执行程序中，追加被执行人是一个严肃的法律行为，它直接涉及到第三人的实体和程序权利。根据一般的执行原则，执行程序主要针对的是生效法律文书所确定的被执行人，即直接承担法律责任的主体。代持股东，作为名义上的股东而非实际控制人或受益人，在一般情况下，并不直接成为执行程序的对象。
二、特定情形：可依据相关法律规定申请追加
尽管一般原则下不能直接追加代持股东为被执行人，但在某些特定情形下，如代持股东未履行出资义务等，申请执行人可以依据相关法律规定申请追加其为被执行人。
未履行出资义务：
- 根据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第十七条，作为被执行人的营利法人，财产不足以清偿生效法律文书确定的债务时，申请执行人可以申请变更、追加未缴纳或未足额缴纳出资的股东、出资人或依公司法规定对该出资承担连带责任的发起人为被执行人，在尚未缴纳出资的范围内依法承担责任。
- 如果代持股东作为名义股东，实际上未履行出资义务，那么申请执行人可以依据此条规定，申请追加代持股东为被执行人。
其他法定情形：
- 除了未履行出资义务外，如果代持股东的行为符合其他法定追加被执行人的情形，如抽逃出资、滥用股东权利等，申请执行人也可以依据相关法律规定申请追加其为被执行人。
三、申请追加的程序和所需材料
如果申请执行人决定申请追加代持股东为被执行人，需要遵循一定的程序，并准备相应的材料。一般来说，申请追加被执行人需要提交以下材料：
- 原执行案件所依据的法律文书：如民事调解书、判决书等。
- 原执行案件终本裁定书：证明原执行案件已经终结本次执行程序。
- 原执行案件被执行人公司的工商档案：用于证明被执行人的公司情况和股东信息。
- 追加被执行人申请书：详细说明申请追加的理由和依据。
四、法律建议和风险提示
法律建议：
- 在申请追加代持股东为被执行人前，申请执行人应充分调查代持股东的出资情况和行为，确保符合法定追加情形。
- 申请执行人应准备充分的证据材料，以支持其申请追加的理由。
- 申请执行人可以咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和指导。
风险提示：
- 追加被执行人是一个严肃的法律行为，如果申请不当或证据不足，可能会导致申请被驳回或承担其他法律责任。
- 代持股东可能提出异议或反驳，申请执行人应做好应对准备。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。