质疑期限的计算通常以代理收到投标文件的时间为准。具体分析如下：

一. 法律法规依据

1. 《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例：虽然这些法律法规中并未直接明确规定质疑期限的计算是以投标人寄出为准还是代理收到为准，但它们强调了招标文件的提交、接收以及开标等程序应当遵循的公平、公正原则。
2. 通常实践：在招标投标实践中，为了确保所有投标人的权益得到平等对待，避免因邮寄时间差异导致的不公平现象，通常是以招标代理机构或招标人实际收到投标文件的时间作为计算质疑期限的起点。

二. 分析说明

1. 公平性原则：如果以投标人寄出时间为准，那么不同投标人可能因邮寄地点、邮寄方式等因素导致邮寄时间不同，从而可能造成实际上提交时间的不公平。而以代理收到时间为准，可以确保所有投标人在同一时间节点上被平等对待。
2. 实践操作性：从实践操作的角度来看，招标代理机构或招标人在收到投标文件后才能进行后续的开标、评标等工作。因此，以代理收到时间为准也更符合实际工作流程。

三. 结论

综上所述，质疑期限的计算通常以代理收到投标文件的时间为准。这样做既符合招标投标活动的公平性原则，也便于实际操作和管理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。