农村合法审批的建房，办理不动产证与不办理不动产证存在明显的区别，主要体现在法律保护、权益保障以及后续交易或处置的便利性上。
一. 法律保护与权益保障
- 办理不动产证：根据《中华人民共和国土地管理法》第十二条，依法登记的土地的使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。这意味着，办理了不动产证的农村房屋，其使用权得到了法律的明确认可和保护，房主可以依法享有占有、使用、收益和处分的权利。
- 不办理不动产证：若未办理不动产证，虽然房屋可能是基于合法审批建造的，但在法律上，其权益保护可能不如已办理不动产证的房屋充分。在面临纠纷或权益受损时，房主可能难以提供有力的法律证据来维护自己的权益。
二. 后续交易或处置的便利性
- 办理不动产证：拥有不动产证的农村房屋，在进行买卖、抵押、出租等交易或处置时，可以更加便捷地进行。因为不动产证是房屋权属的法定证明，具有公信力，可以方便地办理相关手续。
- 不办理不动产证：未办理不动产证的房屋，在进行上述交易或处置时，可能会面临更多的困难和障碍。例如，买家或金融机构可能会因为缺乏法律上的权属证明而犹豫或拒绝交易，导致房屋难以流通或融资。
我的观点：因此，对于农村合法审批的建房来说，办理不动产证是非常有必要的。它不仅可以为房主提供法律上的保护和权益保障，还可以增加房屋的流通性和融资能力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。