在包干价合同中，对于未完成的项目，结算时是否需要扣除相应款项，应首先遵循合同约定。若合同无明确约定，则需结合法律原则、实际情况及双方协商结果来确定是否扣款及扣款金额。以下是对此问题的详细分析：

一、合同约定优先

1. 明确扣减：

   • 若合同中明确规定了未完成项目的扣款方式及计算依据，例如按未做项目在总价中的占比进行扣减，那么在结算时，应严格依照合同执行，扣除相应的款项。

2. 不扣减情况：

   • 若合同中有特别约定，如只要完成主要目的和关键工作，附属、次要项目未做不影响整体工程交付使用，则可不扣减未做项目的款项。这种情况下，结算时无需扣除未完成项目的费用。

二、合同无约定时的处理

1. 承包商原因导致未做：

   • 若因承包商自身原因（如施工组织不力、资金短缺等）导致项目未完成，业主有权要求从总价中扣除未做项目的合理价款。这通常包括成本加上合理利润，以确保业主的权益不受损害。

2. 非承包商原因导致未做：

   • 业主原因：如业主提出设计变更或提供资料不及时导致项目未做，承包商有权要求业主补偿因变更造成的损失。这种情况下，不应简单扣减费用，而是应就损失进行协商和补偿。
   • 不可抗力：因不可抗力（如自然灾害、政策变化等）导致部分项目无法完成，双方应公平合理地分担损失。通常不会直接从总价中扣除未做项目费用，而是协商解决，如延长工期、调整工作内容等。

三、实际操作中的考虑

• 在处理未完成项目的扣款问题时，除了严格遵循合同约定外，还需考虑实际操作的复杂性。双方应通过友好沟通，了解未完成工作的具体原因及双方意见，寻求都能接受的解决方案。
• 若遇到复杂情况或争议较大，建议及时咨询专业律师（即向我咨询），以确保合法权益得到妥善保护。

四、法律建议

• 在签订包干价合同时，双方应尽可能明确约定未完成项目的处理方式，包括扣款方式、计算依据等，以避免后续争议。
• 若合同未明确约定，双方应秉持公平、合理的原则进行协商，必要时可寻求法律途径解决争议。

总结来说，包干价合同中未完成项目的结算扣款问题，应首先遵循合同约定。若合同无约定，则需结合实际情况和法律原则进行协商处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。