在流转土地上修田间小路是否违法，需依据具体情况判断，以下从不同角度进行分析：
一、合同约定角度
若流转合同中明确规定了土地的使用用途，且未允许修路，那么擅自修路就违反了合同约定。这种情况下，土地流出方（即原土地承包人）有权要求流入方（即土地受让人）承担违约责任，包括停止侵权行为并恢复土地原状。因此，在修路前，务必仔细审查流转合同，确保修路行为符合合同约定。
二、法律规定角度
农用地转用审批：
- 流转土地若属于农用地，依据《土地管理法》等相关法律，农用地转用需经过严格审批程序。未经批准，不得将农用地用于非农业建设，修路属于典型的非农业建设行为。
- 未经审批在农用流转土地上修路，属于违法行为。相关部门有权责令改正，恢复土地原状，甚至可能处以罚款。
农业设施用地规定：
- 若修路是为了农业生产服务，如建设田间道路方便农产品运输、农业机械通行等，且符合相关农业设施用地规定，经过合法审批程序，则是合法的。
- 例如，按照规定办理了设施农用地备案手续，且不破坏耕地耕作层等。这种情况下，修路行为是受到法律保护的。
三、实际操作建议
- 审查合同：在修路前，务必仔细审查流转合同，确保修路行为符合合同约定。
- 了解规定：了解并遵守相关法律法规，特别是关于农用地转用和农业设施用地的规定。
- 办理审批：若修路行为符合农业生产服务需要，且符合相关规定，应依法办理审批手续，确保修路行为的合法性。
- 协商解决：若因修路行为引发纠纷，应首先通过协商解决。协商不成的，可以申请调解、仲裁或提起诉讼。
举例说明：
- 假设甲将一块农用地流转给乙，合同中明确规定土地用途为农业生产，未允许修路。若乙未经甲同意擅自修路，则乙的行为违反了合同约定，甲有权要求乙停止侵权行为并恢复土地原状。
- 假设丙将一块农用地流转给丁，用于农业生产服务。丁为方便农产品运输和农业机械通行，拟修建一条田间道路。若丁依法办理了设施农用地备案手续，且不破坏耕地耕作层，则丁的修路行为是合法的。
总结与建议：
在流转土地上修田间小路是否违法，关键在于是否符合合同约定和法律规定。因此，在修路前，务必仔细审查流转合同，了解并遵守相关法律法规，依法办理审批手续。若因修路行为引发纠纷，应首先通过协商解决，协商不成的可以依法申请调解、仲裁或提起诉讼。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。