结论是：建行信用卡逾期90天后还完，您确实可以申请异议申诉，但能否成功取决于多个因素。
一、异议申诉的法律依据与可行性
根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》等相关规定，持卡人在信用卡逾期后，有权对逾期记录提出异议，特别是当逾期记录存在错误、不准确或非持卡人本人原因导致时。您的情况中，虽然逾期已经90天，但如果您能证明逾期并非完全由您个人原因造成（例如银行系统错误、未及时收到账单通知等），或者逾期记录存在错误，那么您提出异议申诉是有法律依据的，也是可行的。
二、异议申诉的成功因素
逾期原因：
- 如果逾期是由于银行方面的原因（如系统故障、账单寄送错误等）导致的，您提出异议申诉的成功率会相对较高。
- 如果逾期是由于您个人原因（如疏忽、资金紧张等）导致的，虽然也可以提出异议，但成功申诉的难度会相对较大。不过，如果您能提供充分的证据证明您已经采取了积极的补救措施（如及时还款、与银行沟通等），这也会对申诉结果产生积极影响。
还款情况：
- 您已经还清了逾期款项，这显示了您的还款意愿和还款能力，对异议申诉的成功是有帮助的。
证据收集：
- 在提出异议申诉前，您需要收集相关证据来支持您的主张。这些证据可能包括银行系统错误记录、账单寄送记录、与银行沟通的记录等。证据越充分，申诉成功的可能性就越大。
三、异议申诉的流程与建议
联系银行：
- 首先，您需要联系建行信用卡客服部门，了解异议申诉的具体流程和所需材料。
准备材料：
- 根据银行的要求，准备相关的异议申诉材料。这些材料可能包括异议申请书、身份证明、逾期记录证明、还款证明等。
提交申诉：
跟进与沟通：
- 在申诉过程中，保持与银行的沟通，及时了解申诉的进展情况。如果银行需要您补充材料或提供进一步的信息，您需要积极配合。
考虑其他途径：
- 如果银行拒绝了您的异议申诉，或者您对申诉结果不满意，您还可以考虑向银保监会等监管机构投诉，或者通过法律途径解决争议。
四、可能的法律后果与风险提示
- 如果异议申诉成功，银行将更正您的逾期记录，这将对您的信用记录产生积极影响。
- 如果异议申诉失败，或者您未及时采取补救措施，逾期记录可能会继续保留在您的信用报告中，对您的信用评分和未来的信贷申请产生不利影响。
建议您在提出异议申诉前，充分了解相关法律法规和银行政策，收集充分的证据来支持您的主张。如果您在申诉过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。