工程分包者系自然人，且该自然人自己受工伤时，通常由具备用工主体资格的承包单位来承担工伤保险责任。以下是对此问题的详细分析：
一、责任主体
具备用工主体资格的承包单位：
- 当工程被分包给不具备用工主体资格的自然人时，若该自然人自己受工伤，根据相关法律规定，具备用工主体资格的承包单位需承担工伤保险责任。这是因为个人本身不具备用工主体资格，无法直接承担工伤保险责任。
发包单位：
- 如果发包单位将工程发包给了没有用工主体资格的自然人，且该自然人受工伤，发包单位也可能需要承担一定的责任。特别是当发包单位明知或应知分包个人无相应资质或安全生产条件仍发包时，存在过错，需与分包个人承担连带赔偿责任。
二、赔偿流程与标准
工伤认定：
- 发生工伤后，首先需要进行工伤认定。单位应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未按时申请，工伤职工或其近亲属、工会组织在1年内可直接提出申请。
赔偿标准：
- 赔偿标准通常包括工伤治疗的医疗费、康复费、停工留薪期的工资等。具体赔偿数额需根据工伤认定结果、劳动能力鉴定结果以及相关法律法规来确定。
- 如果承包单位已经给劳动者缴纳了工伤保险，那么由工伤保险基金来支付相应的工伤保险待遇；如果未缴纳，则由承包单位按照工伤保险待遇的项目和标准去支付费用。
三、特殊情况与注意事项
双方过错：
- 如果发包方和承包方都有过错，如发包方未监管分包行为、承包方未提供安全环境等，双方应依过错程度担责。
合同约定与实际履行：
- 在实践中，具体责任认定还需综合合同约定、实际履行等因素。不能简单定由一方单独担责，而要依具体情况分析判定。
追偿权：
- 具备用工主体资格的发包单位在承担赔偿责任后，可依照双方分包合同约定，向该个人进行追偿。
建议：在实际操作中，如果遇到工程分包者系自然人且自己受工伤的情况，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解责任主体、赔偿流程与标准等相关信息，并维护自己的合法权益。如果有任何法律问题，都可以直接向我提问。