公安机关已经取证的流水删除后，该行为是否违法需分情况讨论：
若删除行为由公安机关内部人员实施，且未经法定程序：
- 公安机关在办理案件过程中，依法收集的证据材料，包括流水记录等，是案件定性的重要依据。若内部人员擅自删除已取证的流水，可能构成对证据的破坏或隐匿，违反了《中华人民共和国刑事诉讼法》中关于证据收集、固定和保存的相关规定。
- 具体来说，根据《刑事诉讼法》第五十二条：“审判人员、检察人员、侦查人员必须依照法定程序，收集能够证实犯罪嫌疑人、被告人有罪或者无罪、犯罪情节轻重的各种证据。严禁刑讯逼供和以威胁、引诱、欺骗以及其他非法方法收集证据，不得强迫任何人证实自己有罪。必须保证一切与案件有关或者了解案情的公民，有客观地充分地提供证据的条件，除特殊情况外，并且可以吸收他们协助调查。”擅自删除证据，显然违反了证据收集和保存的法定程序。
- 此行为可能构成违法，甚至可能涉及渎职等刑事责任。
若删除行为由外部人员（如犯罪嫌疑人、被告人或其相关人员）实施：
- 外部人员若擅自删除公安机关已取证的流水，可能构成对证据的破坏或伪造，根据《中华人民共和国刑法》第三百零七条第二款的规定：“帮助当事人毁灭、伪造证据，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役。”若该行为被认定为帮助毁灭、伪造证据罪，将面临刑事处罚。
- 同时，如果删除行为导致案件无法正常审理或造成严重后果，还可能构成其他犯罪，如妨害作证罪等。
- 此行为同样违法，且可能面临刑事处罚。
若删除行为因系统故障、误操作等非人为故意原因导致：
- 在这种情况下，虽然删除行为本身并非出于故意，但公安机关仍需承担证据丢失的责任。根据相关规定，公安机关应建立完善的证据管理制度，确保证据的安全和完整。若因管理不善导致证据丢失，可能面临内部纪律处分或行政责任。
- 此行为虽不构成故意违法，但公安机关需承担相应责任，并应采取措施恢复或补救证据。
法律建议：
- 对于公安机关内部人员，应严格遵守证据收集和保存的法定程序，不得擅自删除或修改证据。
- 对于外部人员，应尊重法律程序，不得干扰或破坏证据的收集和保存。
- 若发生证据丢失或损坏的情况，应及时报告并采取补救措施，以减轻可能面临的法律责任。
可能后果：
- 擅自删除已取证的流水，可能导致案件无法正常审理，影响司法公正和效率。
- 涉及违法行为的，将面临刑事处罚或行政责任，对个人和单位造成严重后果。
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