小产权房第二购买人在物业办理装修是否合法，需结合具体情况判断，无法直接给出合法或违法的绝对结论。以下从不同角度进行分析：

一、合同效力与产权归属

1. 若第二购买人合同有效且产权无争议：

   • 若第二购买人通过合法有效的合同获得了小产权房的使用权，且该合同未被撤销或认定无效，同时该房屋产权不存在其他争议（如未被原产权人或其他买受人主张权利），则第二购买人对房屋进行装修的行为，在物业允许且符合相关规定的情况下，可以视为合法。但需注意，小产权房本身因未缴纳土地出让金等费用，无法办理正规的产权证，其产权合法性存在一定风险。

2. 若合同效力存疑或产权有争议：

   • 若第二购买人与出售人签订的合同存在效力问题（如出售人无权处分、合同存在欺诈或恶意串通等），或者该房屋产权已被其他买受人主张权利，则第二购买人对房屋进行装修的行为可能构成侵权。此时，物业允许装修的行为也可能因未尽到审查义务而承担一定责任。

二、物业的审查义务

• 物业在允许业主或使用人进行装修时，通常负有一定的审查义务，包括审查装修人的身份、装修合同的有效性以及装修是否符合相关规定等。若物业未尽到审查义务，导致装修行为引发纠纷，物业可能需要承担相应的法律责任。

三、法律建议与风险提示

1. 审查合同与产权：

   • 第二购买人在进行装修前，应仔细审查与出售人签订的合同，确保合同合法有效且无争议。同时，应了解该房屋的产权情况，避免装修后因产权问题引发纠纷。

2. 咨询专业意见：

   • 由于小产权房的产权合法性存在风险，且涉及的法律问题较为复杂，建议第二购买人在进行装修前咨询专业律师的意见，以确保自身权益不受损害。

3. 注意装修合规性：

   • 即使合同有效且产权无争议，第二购买人在进行装修时也应遵守相关规定，如不得擅自改变房屋结构、不得影响邻居正常生活等。否则，即使装修行为本身合法，也可能因违反规定而面临处罚。

总结来看，小产权房第二购买人在物业办理装修是否合法，需结合合同效力、产权归属、物业审查义务以及装修合规性等多方面因素进行综合判断。若您在此方面存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。