若摩托车在国道辅路红灯时直行，属于违反交通信号灯通行的行为，通常会被处以罚款并扣分。具体处罚情况如下：

1. 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。对于闯红灯的行为，一般会处以二百元的罚款。

2. 扣分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。这意味着，如果摩托车在红灯时直行，驾驶人的驾驶证将会被扣除6分。

特殊情况说明：

• 如果辅路有专门的交通信号灯：且该信号灯显示红灯时，摩托车直行则明确构成闯红灯行为，将按照上述标准进行处罚。

• 如果辅路没有专门的交通信号灯：但主路信号灯为红灯时，摩托车是否构成闯红灯需根据具体情况判断。若辅路与主路之间有明确的分隔且辅路有通行权（如辅路信号灯为绿灯或无信号灯但主路让行），则可能不构成闯红灯；但若辅路与主路混行或辅路无明确通行权，摩托车直行仍可能被视为违反交通信号。不过，在大多数情况下，如果辅路没有专门的信号灯，且主路红灯时辅路也不应通行，因此摩托车直行很可能被处罚。

建议：

• 驾驶摩托车时，务必严格遵守交通信号灯指示，确保安全通行。
• 如果对辅路的通行规则有疑问，建议提前了解并熟悉相关路段的交通标志和标线。
• 如不慎违反交通规则，应及时接受处理并缴纳罚款，以免产生滞纳金或其他不良后果。

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