针对您提出的问题“企业破产员工已发工资却以未发申请怎么办”，这实际上涉及到了员工在维权过程中可能出现的误解或不当行为。虽然直接的情况是企业已发工资但员工仍申请未发，但我们可以从员工如何正确维权以及企业如何应对此类误解的角度来详细解答。

一、员工角度：如何正确维权及避免误解

1. 核实工资发放情况：

   • 员工在申请任何维权措施前，应首先核实自己的工资是否确实未发放。这可以通过查看银行流水、工资条或与公司财务部门确认来实现。
   • 如果发现工资已发放，但存在金额不符、时间延迟等问题，应与公司沟通解决，而非直接申请未发工资。

2. 保留证据：

   • 无论工资是否发放，员工都应保留好与工资相关的所有证据，如劳动合同、工资条、银行流水、考勤记录等。
   • 这些证据在后续可能出现的维权过程中将起到关键作用。

3. 正确维权途径：

   • 如果确认工资未发放，员工应通过合法途径维权，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼。
   • 在维权过程中，应如实陈述事实，提供准确证据，避免夸大或虚构事实。

二、企业角度：如何应对员工误解或不当申请

1. 及时沟通：

   • 如果企业发现员工误以为工资未发放而提出申请，应第一时间与员工沟通，解释工资发放情况，并提供相关证据。
   • 通过沟通，可以消除误解，避免不必要的法律纠纷。

2. 提供证据：

   • 企业应准备好工资发放的相关证据，如银行转账记录、工资条签收记录等，以证明工资已按时发放。
   • 这些证据在应对员工申请或劳动监察部门调查时将起到关键作用。

3. 法律应对：

   • 如果员工坚持认为工资未发放并提起诉讼或仲裁，企业应积极应对，提供充分证据证明工资已发放。
   • 在法律程序中，企业应遵守法律程序，如实陈述事实，提供准确证据，维护自身合法权益。

三、特殊情况处理：员工恶意申请

• 如果发现员工恶意申请未发工资，企图通过不正当手段获取利益，企业应收集相关证据，如工资发放记录、员工沟通记录等，并向劳动监察部门或公安机关报案。
• 恶意申请未发工资可能构成欺诈行为，企业有权通过法律途径追究员工的法律责任。

总结与建议

面对企业破产但员工已发工资却以未发申请的情况，企业和员工都应保持冷静和理智。员工应核实工资发放情况，通过合法途径维权；企业应积极沟通，提供证据，应对可能的法律纠纷。同时，建议企业在日常运营中加强工资管理，确保工资按时、准确发放，并保留好相关证据，以应对可能出现的争议。