申请过困难补助的员工，用人单位并非绝对不能辞退，但辞退行为必须合法合规，否则可能面临法律风险。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合法辞退的情形

• 员工存在严重过错：如果申请过困难补助的员工存在严重违反公司规章制度、失职或营私舞弊给公司造成重大损害等行为，用人单位可以依据《劳动合同法》的相关规定，合法解除劳动合同。这种情况下，困难补助的申请并不影响辞退的合法性。
• 经济性裁员：在用人单位面临经营困难等客观情况，需要裁减人员时，如果申请过困难补助的员工被纳入裁员范围，且用人单位按照法定程序进行了裁员（如提前三十日向工会或者全体职工说明情况，听取意见，裁减人员方案经向劳动行政部门报告等），则辞退行为也是合法的。

2. 违法辞退的情形及后果

• 无正当理由辞退：如果用人单位仅因为员工申请过困难补助，就无正当理由将其辞退，这种行为可能构成违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》的规定，用人单位违法解除劳动合同的，应当向劳动者支付赔偿金，赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。
• 未履行法定程序辞退：即使员工存在可辞退的情形，如果用人单位未按照法定程序进行辞退（如未提前通知、未听取工会或职工意见等），也可能构成违法解除劳动合同，同样需要支付赔偿金。

3. 特殊情况下的保护

• 三期女职工等特殊群体：对于申请过困难补助且处于孕期、产期、哺乳期的女职工，或者法律、行政法规规定的其他不得解除劳动合同的情形（如在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的员工等），用人单位不得依据《劳动合同法》第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。如果用人单位违法解除，将面临更严重的法律后果。

4. 建议与注意事项

• 用人单位：在辞退员工时，应确保辞退行为合法合规，避免因为员工申请过困难补助就随意辞退。同时，应保留好相关证据，以证明辞退行为的合法性。
• 员工：如果认为自己被违法辞退，可以收集相关证据（如劳动合同、辞退通知、工资单等），向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

总结来说，申请过困难补助的员工并非不能辞退，但辞退行为必须合法合规。用人单位在辞退员工时，应仔细审查辞退理由和程序，确保不违反法律规定。如果员工认为自己的权益被侵害，可以依法维权。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。