对于检察院不起诉的案子，税务局的处理方式主要取决于案件的性质以及涉及的税款问题，以下是详细分析：

1. 若案件涉及税款且检察院不起诉决定基于证据不足或情节轻微：

   • 税务调查与补缴：税务局可能会继续对涉案企业或个人进行税务调查，核实是否存在偷税、漏税等违法行为。如果发现存在税款问题，税务局有权要求补缴税款，并可能加收滞纳金或处以罚款。
   • 行政处罚：对于涉嫌偷税、漏税等违法行为，即使检察院不起诉，税务局仍可能根据《税收征收管理法》等相关法律法规，对企业或个人进行行政处罚，如罚款、没收违法所得等。

2. 若案件不涉及税款或检察院不起诉决定基于无罪或免于刑事处罚：

   • 税务合规审查：税务局可能会对企业或个人的税务合规情况进行审查，确保其税务申报、缴纳等符合法律法规要求。如果发现存在不合规情况，税务局会要求进行整改。
   • 无进一步行动：如果案件确实不涉及税款问题，或者检察院的不起诉决定是基于无罪或免于刑事处罚的明确判断，税务局可能不会采取进一步的法律行动，但会保持对涉案企业或个人的税务监管。

3. 特殊情况下的处理：

   • 信息共享与协作：税务局与检察院之间可能存在信息共享机制。在检察院作出不起诉决定后，税务局可能会根据共享的信息，对涉案企业或个人的税务情况进行更深入的审查。
   • 复议或诉讼：如果税务局认为检察院的不起诉决定存在错误，或者对涉案企业或个人的税务处理有异议，税务局可能会通过行政复议或行政诉讼等途径来维护自身权益。

总结与建议：

• 对于检察院不起诉的案子，税务局的处理方式会因案件性质和涉及税款问题的不同而有所差异。
• 如果您或您的企业涉及此类案件，建议积极配合税务局的调查和审查工作，确保税务合规，避免不必要的法律风险。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。