建设单位让施工单位垫资施工的行为，主要由住房和城乡建设部门进行查处。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、查处部门
住房和城乡建设部门：
- 住房和城乡建设部门是负责建筑工程管理、监督和执法的主要部门。对于建设单位要求施工单位垫资施工的行为，该部门有权进行查处，因为这种行为可能违反了建筑工程管理的相关规定，如关于工程款支付、合同履行等方面的规定。
其他相关部门：
- 虽然住房和城乡建设部门是主要的查处部门，但在某些情况下，其他相关部门如市场监管部门、财政部门等也可能根据具体情况参与查处。例如，如果垫资施工行为涉及不正当竞争或财务违规，市场监管部门或财政部门可能会介入。
二、查处依据
法律法规：
- 查处建设单位让施工单位垫资施工的行为，主要依据的是相关的建筑工程管理法律法规，如《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》等。这些法律法规明确规定了工程款的支付方式、合同履行要求等，为查处提供了法律依据。
合同条款：
- 除了法律法规外，建设单位和施工单位之间的合同条款也是查处的重要依据。如果合同中明确规定了工程款的支付方式和时间，而建设单位却要求施工单位垫资施工，那么这种行为就违反了合同条款，施工单位可以据此向相关部门投诉或寻求法律救济。
三、法律后果
行政处罚：
- 如果建设单位让施工单位垫资施工的行为被查处，建设单位可能会面临行政处罚，如罚款、责令改正等。这些处罚措施旨在维护建筑工程市场的秩序和公平竞争环境。
民事责任：
- 除了行政处罚外，建设单位还可能承担民事责任。如果因垫资施工导致施工单位遭受损失，施工单位有权要求建设单位进行赔偿。这种民事责任是基于合同关系或侵权关系而产生的。
四、建议与措施
加强合同管理：
- 建设单位和施工单位在签订合同时，应明确工程款的支付方式和时间，避免出现垫资施工的情况。同时，双方应严格遵守合同条款，确保合同的履行。
增强法律意识：
- 建设单位和施工单位应增强法律意识，了解相关的建筑工程管理法律法规和合同条款。在出现争议或纠纷时，应及时寻求法律救济或向相关部门投诉。
加强监管力度：
- 住房和城乡建设部门应加强对建筑工程市场的监管力度，及时发现和查处垫资施工等违规行为。同时，应建立健全的投诉举报机制，鼓励施工单位和社会公众积极参与监督。
作为专业律师，我建议您在遇到类似问题时，及时咨询并寻求法律帮助，以确保自身权益得到保障。如果您有任何关于建设工程或劳动工伤方面的法律问题，都可以直接向我咨询。