建设用地上的违法建筑是否适用没收，需分情况讨论：

1. 非法占用建设用地且符合土地利用总体规划的情形：

   • 根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，若违法占用的土地为建设用地且符合土地利用总体规划，除责令退还非法占用的土地、可以并处罚款外，还可以对非法占用土地上的建筑物予以没收。
   • 例如，某企业未经审批占用集体建设用地进行厂房建设，若该建设行为符合当地的土地利用总体规划，则相关部门在责令企业退还土地并处罚款的同时，有权没收该厂房。

2. 非法占用建设用地但不符合土地利用总体规划的情形：

   • 虽然《土地管理法》第七十七条未直接规定对非法占用建设用地且不符合土地利用总体规划的建筑物如何处理，但按照“法无规定不可为”的行政原则，不宜作出拆除或没收的处罚。
   • 在此情况下，除责令退出土地及可以并处罚款外，对地上建筑物或设施，应由违法当事人与合法的土地所有者或使用者协商处置。若涉及违反《城乡规划法》的，应当转交城乡规划主管部门处理。
   • 例如，某居民在未经批准的建设用地上擅自搭建房屋，且该搭建行为不符合土地利用总体规划，则相关部门在责令居民退还土地并处罚款后，不会直接拆除或没收该房屋，而是由居民与土地所有者或使用者协商处理。

3. 特殊情形下的处理：

   • 根据《自然资源违法行为立案查处工作规程》的观点，查处违法占用土地行为时，若违法占用的土地为建设用地，应责令退还土地，并可以并处罚款。对地上新建建筑物和其他设施，由违法当事人与合法的土地所有者或者使用者协商处置。
   • 此外，若没收的违法建筑物涉及后续处置问题，如移交、接收、保管、处置等，目前在国家层面没有可操作性规定，需要各地制订具体办法。

法律建议：

• 对于非法占用建设用地的行为，建议当事人首先确认自己的建设行为是否符合土地利用总体规划。
• 若符合规划，应积极配合相关部门的处罚决定，包括退还土地、缴纳罚款以及接受建筑物的没收。
• 若不符合规划，应与土地所有者或使用者协商处置地上建筑物或设施，并避免涉及违反《城乡规划法》的行为。
• 在任何情况下，都应遵守相关法律法规，避免非法占用土地和进行违法建设。

可能法律后果：

• 若非法占用建设用地且符合土地利用总体规划，当事人可能面临退还土地、缴纳罚款以及建筑物被没收的法律后果。
• 若非法占用建设用地但不符合土地利用总体规划，当事人可能面临退还土地、缴纳罚款以及与土地所有者或使用者协商处置地上建筑物或设施的法律后果。若涉及违反《城乡规划法》的，还可能面临城乡规划主管部门的进一步处理。