旷工一天被开除还要扣两天工资，这一做法通常是不合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
法律规定角度
工资支付原则：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，劳动者有权获得与其劳动相对应的报酬，用人单位不得随意扣除。
经济损失赔偿限制：虽然《工资支付暂行规定》第十六条允许因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失时，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，并从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。且若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一规定限制了用人单位因劳动者旷工而扣除工资的额度。
规章制度合理性角度
规章制度的制定与执行：用人单位依法制定并向劳动者公示的规章制度，如果内容不违反法律法规的强制性规定，且制定程序合法，则可以作为处理旷工行为的依据。然而，规章制度中关于旷工扣工资的规定必须合理，且不得违反法律关于扣除工资上限的规定。
扣薪标准的合理性：旷工一天扣除两天工资的做法，超出了合理范围。按照正常逻辑，旷工一天扣除当天工资是合理的，但扣除两天工资则属于对劳动者权益的过度侵害。这种做法不仅违反了工资支付原则，也可能违反了用人单位规章制度中关于扣薪标准的合理性要求。
劳动者权益保护角度
协商解决：如果劳动者认为用人单位扣工资的行为不合理或违法，首先应与用人单位协商解决。在协商过程中，劳动者可以要求用人单位提供扣除工资的合法依据，并解释扣除额度的合理性。
投诉与仲裁：协商不成的，劳动者可以向单位所在地的劳动监察大队投诉立案处理，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。劳动监察部门或劳动仲裁机构将根据法律规定和实际情况，对用人单位的扣工资行为进行审查，并作出相应的处理决定。
建议与后果：
建议：对于劳动者而言，如果遇到旷工一天被开除还要扣两天工资的情况，应首先与用人单位协商解决。协商不成的，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。同时，劳动者也应了解自己的权益和法律规定，以便在维权过程中能够有理有据地主张自己的权利。
后果：如果用人单位坚持执行不合理的扣工资规定，可能会面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决。这不仅会影响用人单位的声誉和形象，还可能给用人单位带来经济损失和法律风险。
综上所述，旷工一天被开除还要扣两天工资的做法通常是不合法的。劳动者在遇到这种情况时，应积极维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。