结论前置：

1. 旷工1天扣3天工资的做法，在大多数情况下是不合法的。它违反了《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》中关于不得克扣劳动者工资的规定。
2. 但在特定情况下，如果公司规章制度合法、合理且经过员工同意或认可，并明确规定了此类处罚措施，且不违反法律法规，那么这种做法可能是被允许的。不过，这种情况较为少见，且需要严格的条件限制。

详细分析：

法律依据

• 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一条款明确规定了工资支付的原则，即不得克扣或无故拖欠。
• 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。这一条款限制了用人单位因劳动者原因造成经济损失时的扣款额度。

旷工1天扣3天工资的合法性分析

1. 超出法定扣薪范围：旷工是指劳动者无正当理由未按规定提供劳动。公司可以不支付旷工当天的工资，这是合理的。但“旷工1天扣3天工资”实际上多扣了劳动者2天的工资，这属于克扣工资的行为，违反了上述法律中关于不得克扣劳动者工资的规定。
2. 缺乏事实依据与合理性：公司需要证明旷工1天会给其造成相当于3天工资的经济损失，否则适用此类处罚没有事实依据。同时，即使存在经济损失，也需要考虑处罚的合理性，不能随意设定高额罚款。例如，若员工日薪为300元，旷工一天被扣900元，这种远超实际损失的处罚既不合理也不公平。
3. 规章制度的合法性：虽然公司可以制定规章制度来管理员工，但这些制度必须合法、合理，且经过员工的同意或认可（如通过工会等组织）。如果规章制度本身存在违法或不合理的情况，那么其中的处罚措施也是无效的。例如，规章制度中若规定“旷工1天扣3天工资”，且未经员工同意或认可，那么这一规定就是不合法的。

特殊情况下的合法性探讨

在极少数情况下，如果公司规章制度合法、合理且经过员工同意或认可，并明确规定了“旷工1天扣3天工资”的处罚措施，且该规定不违反法律法规（如未超过当月工资的20%且扣除后剩余工资不低于当地月最低工资标准），那么这种做法可能是被允许的。但这种情况需要严格的条件限制，且在实际操作中较为少见。

建议与操作指南

• 协商与沟通：如果公司存在此类违法扣薪的情况，劳动者首先应与公司进行协商，要求其按照法律规定支付工资。
• 投诉与仲裁：若协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或仲裁时，劳动者需要提供相关证据（如工资条、考勤记录等）来证明公司的违法行为。
• 法律意识提升：劳动者应增强自己的法律意识，了解自己的权益和义务。在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付和旷工处罚的条款。

总结与提醒：

旷工1天扣3天工资的做法在大多数情况下是不合法的。劳动者在遇到类似问题时，应积极维护自己的合法权益，通过协商、投诉或仲裁等方式来解决问题。同时，公司也应遵守相关法律法规，制定合法、合理的规章制度来管理员工。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。