在仲裁程序中，当存在多个被申请人时，确定保全法院的原则及操作方式如下：
一、确定保全法院的基本原则
仲裁中财产保全：
- 原则上，仲裁中的财产保全应当由被申请人住所地或者财产所在地的基层人民法院管辖。这是根据《最高人民法院关于实施<中华人民共和国仲裁法>几个问题的通知》的规定来执行的。
- 对于涉外仲裁案件，则由被申请人住所地或者财产所在地的中级人民法院作出裁定。
仲裁前财产保全：
- 仲裁前财产保全应当由被保全财产所在地、被申请人住所地或者对案件有管辖权的人民法院管辖。但这一选择应当符合级别管辖和专属管辖的约定，并参照《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定。
二、多个被申请人时的保全法院选择
分别申请：
- 当存在多位被申请人，且被申请人的住所地和财产所在地分属于不同法院辖区时，申请人可以同时向不同财产所在地法院申请财产保全。即，每个法院负责保全其辖区内的财产。
- 目前法律并未限制仲裁中向多家法院申请财产保全，但申请人需确保向多家法院申请的财产保全金额之和不超过仲裁请求总金额，以避免构成超标的额保全。
申请人选择：
- 具体向哪个法院提交保全申请，应由仲裁当事人自行选择决定。当事人在向仲裁委员会提交相关仲裁保全材料时，应明确指定具体的人民法院。
三、实际操作中的注意事项
与仲裁委员会沟通：
- 如果申请人需要通过仲裁委员会分别向多家法院申请财产保全，应与仲裁委员会进行充分沟通，确保申请流程的顺利进行。
保全措施费：
- 向多家法院申请财产保全可能会涉及分别立案的情形，这可能导致保全措施费总额超过一定限制（如5000元）。申请人需提前了解并准备相应的费用。
法律文书准备：
- 申请人需准备充分的法律文书，包括仲裁申请书、财产保全申请书、相关证据材料等，以确保申请的合法性和有效性。
四、特殊规制
- 对于中国国际经济贸易仲裁委员会、深圳国际仲裁院等特定仲裁机构受理的标的额较大或具有重大影响的国际商事纠纷案件，可以直接向最高人民法院国际商事法庭申请财产保全。这提供了更为便捷和高效的保全途径。
建议：在实际操作中，申请人应根据具体情况和需求，合理选择保全法院，并与仲裁委员会和法院保持密切沟通，以确保保全申请的顺利进行和有效执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。