针对您提出的“亏损企业更改薪酬体系怎么办”的问题，这是一个涉及员工权益和企业经营管理的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解企业亏损与薪酬调整的关系
首先，需要明确的是，企业亏损并不直接等同于可以随意调整员工薪酬。薪酬调整必须遵循法律法规、劳动合同以及企业内部规章制度的规定。企业亏损可能成为调整薪酬的一个考量因素，但绝非唯一或决定性因素。
二、企业调整薪酬的合法流程
民主协商程序：
- 根据《劳动合同法》第四条，企业在制定、修改或决定有关劳动报酬等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 这意味着，企业不能单方面决定降薪，而必须通过民主协商程序，确保员工的知情权和参与权。
公示或告知义务：
- 企业应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。这是确保员工了解并遵守新规定的重要步骤。
合同变更程序：
- 如果薪酬调整涉及到劳动合同的变更，企业还需要与员工协商一致并签署书面协议。这是保护员工权益、避免法律纠纷的关键环节。
三、员工如何应对薪酬调整
与公司沟通：
- 员工可以首先尝试与公司沟通，了解降薪的具体原因、合法性和必要性。如果公司不能给出充分的理由或解释不合理，员工可以提出异议。
查阅劳动合同和公司制度：
- 员工应仔细查阅自己的劳动合同和公司制度，了解公司降薪的具体规定和流程。如果公司降薪违反了合同约定或公司制度，员工可以依据这些证据来维权。
投诉举报：
- 如果公司坚持不合理的降薪行为，员工可以向当地劳动监察部门或劳动仲裁机构投诉举报。这些机构会对公司的降薪行为进行调查和仲裁，保护员工的合法权益。
四、特殊情况下的薪酬调整
- 在某些特殊情况下，如企业因经营严重困难而需要调整薪酬时，企业应确保调整过程合法合规，并尽可能与员工进行充分沟通。同时，调整后的薪酬水平不得低于当地最低工资标准。
五、案例分析
以某农资公司为例，该公司在连续两年亏损后，通过召开全体职工大会并经表决过半数同意通过了新的薪酬管理办法。尽管有员工投了反对票，但仲裁委认为该公司的调整过程合法有效，并未违反劳动合同约定和《劳动合同法》的相关规定。这说明了在合法合规的前提下，企业因经营困难而调整薪酬是可能被认可的。
六、总结与建议
- 企业应合法合规调整薪酬：确保调整过程遵循法律法规、劳动合同以及企业内部规章制度的规定。
- 员工应积极维护自身权益：通过沟通、查阅合同、投诉举报等方式来维护自己的合法权益。
- 建议企业与员工建立良好沟通机制：在调整薪酬前充分与员工沟通，解释调整的原因和必要性，争取员工的理解和支持。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。