招标文件合同条款争议解决方式在特定条件下是可以调整的，但需区分实质性内容与非实质性内容。以下是对此问题的详细分析：

一、实质性内容不可调整

根据《招标投标法》及相关规定，招标人和中标人不得订立背离合同实质性内容的其他协议。合同的实质性条款，包括但不限于合同标的、数量和质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式、违约责任以及解决争议的方法等，是合同的核心内容，直接关系到双方当事人的利益和交易的公平性。这些实质性条款在招标投标完成后是不可调整的，即必须响应招标文件的要求。

二、非实质性内容可协商调整

对于非实质性内容，如一些细节性的条款或双方认为需要进一步明确的事项，双方可以通过协商一致进行调整。这种调整是在不违背法律法规和招标文件实质性要求的前提下进行的，旨在更好地满足双方的实际需求和促进合同的顺利履行。

三、调整的程序与注意事项

1. 在招标阶段提出异议：潜在投标人在拿到招标文件后，应第一时间对合同实质性条款做详细审查。一旦发现不合理的条款，应及时在指定期限内对招标文件中的合同文本提出异议，要求修改。超出异议期即丧失了对招标文件提出修改的建议权。

2. 协商一致：对于非实质性内容的调整，双方应通过友好协商达成一致意见，并确保调整后的条款不违反法律法规和招标文件的实质性要求。

3. 书面确认：无论是对实质性内容还是非实质性内容的调整，都应以书面形式进行确认，并作为合同附件或补充协议与主合同一并保存。

四、法律后果

如果招标人和中标人擅自订立背离合同实质性内容的其他协议，可能会面临法律责任。根据《招标投标法》的规定，这种行为可能会被视为无效，并可能受到相关监管部门的处罚。

建议：

• 在参与招标投标活动时，务必仔细阅读招标文件中的合同条款，特别是实质性条款部分。
• 如发现不合理的条款，应及时在指定期限内提出异议。
• 对于非实质性内容的调整，应通过友好协商达成一致意见，并以书面形式进行确认。

如有任何关于招标文件合同条款争议解决方式的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。