核心前提：用户发现老板的情人（俗称“小三”）在公司任职，可能涉及职场伦理、公司管理规范及潜在法律风险。
核心结论：需分情况处理，既要维护自身权益，也要避免因不当行为引发法律纠纷。具体建议如下：

1. 若关注职场公平性：

   • 法律角度：我国《劳动法》《劳动合同法》未禁止亲属或特殊关系者在同一单位工作，但若该员工存在“利用关系获取不当利益”（如晋升、薪资明显高于同岗位）、“干扰正常工作秩序”（如排挤同事、泄露机密）等行为，可能违反公司规章制度或《反不正当竞争法》（若涉及商业秘密泄露）。
     
   • 建议行动：
     
     • 收集证据（如聊天记录、邮件、考勤记录等），证明其存在违规行为；
       
     • 向公司人力资源部门或上级反映（需通过正式渠道，如书面投诉），要求公司依据制度处理；
       
     • 若公司包庇，可向劳动监察部门投诉（如12333热线），但需注意投诉内容需基于客观事实，避免诽谤。
       

2. 若担心自身权益受损：

   • 法律角度：若该员工的行为直接导致你被降薪、调岗、解雇等，可能构成“违法解除劳动合同”或“歧视”，你可依据《劳动合同法》第38条、第46条主张经济补偿；若涉及性骚扰或言语侮辱，可依据《民法典》第1010条主张侵权责任。
     
   • 建议行动：
     
     • 保留证据（如录音、视频、证人证言）；
       
     • 先与公司协商解决，协商不成可申请劳动仲裁；
       
     • 若涉及人身攻击，可报警处理。
       

3. 若考虑道德与职场环境：

   • 法律边界：单纯“老板与员工存在不正当关系”不违法，但若该关系导致公司管理混乱（如财务违规、决策偏袒），可能涉及“公司高管忠实义务”问题（《公司法》第147条），股东可主张其赔偿损失。
     
   • 建议行动：
     
     • 若你是股东或高管，可联合其他股东要求董事会调查；
       
     • 若你是普通员工，可向工会反映（若有），或选择离职（需注意离职经济补偿问题）。
       

风险提示：

• 避免公开传播未经证实的“小三”信息，否则可能构成名誉权侵权（《民法典》第1024条）；
  
• 投诉时需基于事实，避免夸大或虚构，否则可能被反诉诽谤；
  
• 若公司以此为由解雇你，需保留解雇通知等证据，主张违法解除赔偿。
  

总结：处理此类问题需以法律为依据，以证据为支撑，优先通过公司内部渠道解决，无效时再寻求劳动仲裁或诉讼。若需进一步分析具体证据或方案，可直接向我提问。