工厂超过12小时工作时长，在未经特定程序和批准的情况下，是违法的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益、维护劳动者身体健康的重要法律基础。对于延长工作时间，法律也有严格限制：

• 经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；
• 在特殊原因下，且需保障劳动者身体健康的条件下，延长工作时间每日也不得超过三小时，并且每月累计不得超过三十六小时。

工厂若长时间安排员工每日工作超过十二小时，明显超出了法律规定的正常工作时间和加班时长限制，构成了对劳动者合法权益的侵害。

二、特殊情况下的合法性探讨

虽然法律对工作时间有严格限制，但也存在一些特殊情况。例如，某些特殊行业或岗位可能因工作性质或生产特点需要实行不同的工时制度。然而，这必须经过劳动行政部门的严格审批，并且必须确保劳动者的权益得到充分保障。在未经批准的情况下，任何超出法定工作时间的安排都是违法的。

此外，如果劳动者与用人单位事先就超时工作进行了协商，并且劳动者自愿接受，同时用人单位按照法律规定支付了相应的报酬（如加班费），那么这种情况可能不被直接认定为违法。但这种特殊情况应该是偶尔发生且有合理事由，不能成为常态。

三、法律后果与维权途径

如果工厂未经审批延长劳动者工作时间超出法定限制，属于违反劳动法的行为。用人单位应依法承担以下责任：

• 支付加班费：根据《劳动法》第四十四条，安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定节假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

• 行政处罚：劳动行政部门有权对违法延长工作时间的用人单位进行查处，并可能给予相应的行政处罚。

对于劳动者而言，如果面对工厂超时工作的违法行为，可以通过以下途径维护自己的权益：

1. 向劳动监察部门投诉：劳动者可以向当地劳动监察部门提出投诉，请求其对工厂的违法行为进行查处。
2. 通过劳动仲裁维权：劳动者还可以通过劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，要求工厂支付加班工资、经济补偿等应得权益。

工厂超过12小时工作时长在未经特定程序和批准的情况下是违法的。劳动者在面对此类违法行为时，应勇敢站出来，通过法律途径维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。