工厂洗手间设门禁是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合法目的与合规安装：

   • 若工厂安装门禁的目的是为了保障正常生产秩序、维护公共安全或防止特定物品的流失等合法目的，并且安装过程符合相关建筑规范和安全标准，那么这种安装行为通常是合法的。例如，某些工厂可能因生产需要，对进出特定区域进行严格管理，洗手间作为工厂的一部分，其门禁设置若出于此类合法目的，且不影响员工正常使用，则可能被视为合法。

2. 侵犯员工基本权益：

   • 如果安装门禁的目的是侵犯员工的基本权益，如限制员工合理使用厕所的自由，导致员工在工作时间内无法及时使用厕所，影响其正常生理需求，那么这种行为就可能构成违法。根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，员工享有合理的工作条件和休息时间，包括使用洗手间的权利。工厂若通过门禁设置不合理地限制这一权利，可能面临法律纠纷。

3. 具体实施与影响评估：

   • 在判断工厂洗手间设门禁是否合法时，还需考虑门禁的具体实施方式及其对员工权益的实际影响。例如，门禁是否设置了合理的开放时间、是否提供了应急开启机制、是否对员工进行了充分的告知和培训等。如果门禁设置导致员工在紧急情况下无法及时使用洗手间，或者给员工带来了不必要的困扰和不便，那么这种设置就可能被视为不合理或违法。

法律建议：

• 工厂在设置洗手间门禁时，应充分考虑其合法性和合理性，确保不侵犯员工的基本权益。
• 如果员工认为工厂洗手间门禁设置不合理或侵犯了其权益，可以通过与工厂协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果工厂因设置不合理的洗手间门禁而侵犯了员工的权益，可能面临劳动监察部门的处罚或员工的法律诉讼，包括但不限于赔偿损失、恢复原状等。

综上所述，工厂洗手间设门禁是否合法需根据具体情况进行判断。如果您对此有进一步的疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。