若遇到收款单位毁灭证据不承认的情况，您可以通过以下途径来维护自身权益：
一、收集间接证据
转账记录：如果您是通过银行转账、第三方支付平台等方式进行付款的，这些转账记录能够清晰地显示资金的流向，是证明您已付款的有力证据。
聊天记录与通话录音：检查您与收款单位之间的聊天记录或通话录音，看其中是否涉及收钱的内容。这些记录可以作为双方对收款事项沟通的证明。
证人证言：如果有第三方见证了您与收款单位之间的交易过程，可以尝试联系这些证人，并请他们出具证人证言，以佐证您的付款事实。
二、与收款单位沟通并录音录像
合法沟通：尝试与收款单位进行沟通，表达您的诉求和困惑。在沟通过程中，确保您的行为合法合规，不要采取过激或违法的手段。
录音录像：在沟通时，您可以合法合规地进行录音录像，以记录下对方的陈述和态度。如果可能的话，引导对方承认收钱的事实，但务必保证方式合法，避免侵犯对方的合法权益。
三、申请调查取证
向法院申请：如果涉及的金额较大，或者您认为有必要进一步调查取证，您可以向法院提出申请，要求法院调查收款单位的资金往来情况。法院有权根据申请，向银行等金融机构调取相关证据。
配合调查：在法院调查过程中，您需要积极配合，提供必要的协助和信息。这有助于法院更全面地了解案件情况，从而作出公正的裁决。
四、考虑法律途径
起诉准备：如果经过上述努力，您仍然无法收集到有效的证据来证明收款单位已收钱，但您有充分的理由相信对方确实收到了款项，并且对方的行为给您造成了损失，那么您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。在起诉前，您需要准备好相关的证据材料，并撰写好起诉状。
遵循举证原则：在诉讼过程中，您需要遵循“谁主张，谁举证”的原则。这意味着您需要提供充分的证据来支持您的主张。如果证据不足或存在瑕疵，可能会影响您的胜诉几率。
法院裁决：法院会综合双方提供的证据进行判断。如果证据确实充分，法院会支持您的诉求，并判定收款单位承担相应的责任。这可能包括返还款项、赔偿损失等。
后续行动建议：
尽快行动：时间就是证据，您需要尽快采取行动来收集证据和固定事实。拖延时间可能会导致证据灭失或变得难以收集。
保持冷静：在处理这类纠纷时，保持冷静和理性至关重要。不要因为情绪激动而采取过激或违法的行为，这可能会给您带来不必要的麻烦。
寻求专业帮助：如果您在处理这类纠纷时感到困惑或无助，可以考虑寻求专业律师的帮助。律师具有专业的法律知识和经验，能够为您提供更全面和准确的法律建议。
希望以上建议能够对您有所帮助。如果您有任何进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。