自然人（包括法定代表人以自然人身份）确实可以代开发票，但需遵循相关规定和流程。以下是对这一问题的详细解答：

一、自然人代开发票的基本概述

自然人在发生增值税应税行为时，如需开具发票，有权向税务机关申请代开。这一规定同样适用于法定代表人，当其以自然人身份参与经济活动并需要提供发票时，也可以按照相关规定申请代开。例如，自然人出租房屋或提供劳务服务后，若对方要求提供发票，自然人（包括法定代表人）即可前往税务机关代开相应发票。

二、自然人代开发票的条件与要求

1. 身份要求：

   • 自然人必须是中国大陆公民。
   • 法定代表人以自然人身份代开发票时，应避免使用其受票方企业股东身份，以防关联交易带来的税务风险。

2. 业务真实性：

   • 代开发票的前提是业务真实发生。
   • 合同流、资金流、发票流和货物流（或劳务流）需相互统一，这是税务机构判定交易真实性的主要依据。

三、自然人代开发票的方式及流程

1. 税务大厅代开：

   • 个人（包括法定代表人）需按照相关要求准备好代开资料，如身份证、合同等证明业务真实性的文件。
   • 可自行前往当地税务大厅或通过线上税务局操作开具发票。
   • 在此方式下，一般需缴纳增值税及小额附加税、印花税，个人所得税由受票方按个人劳务报酬所得代扣代缴（税率通常为20%~40%）。

2. 税收扶持园区代开：

   • 对于利润高、金额大的业务，个人（包括法定代表人）可选择到部分税收园区内申请代开。
   • 只需办理简单的临时税务登记即可。
   • 个税可按较低比例（如0.5%~1.5%）核定征收，综合税率较低（如1.56%~2.56%）。

四、注意事项与风险提示

1. 限额与税率：

   • 自然人代开发票通常有限额要求，具体限额和税率可能因地区和政策不同而有所差异。务必了解并遵守当地规定。

2. 业务真实性：

   • 务必确保业务真实发生，避免虚构业务或发票金额与实际不符的情况，以免引发税务风险。

3. 比例控制：

   • 个体户发票和自然人代开的发票占公司总成本或总费用的比例应合理控制。一般来说，占总公司比例30%左右相对合理，但具体比例可能因地区而异。过高比例可能引起税务部门的关注。

五、结论

综上所述，法定代表人以自然人身份代开发票是合法且有效的做法，但务必遵循相关规定和流程，确保业务真实性，并选择合适的代开方式。同时，也应注意相关事项和风险提示，以避免潜在的税务问题。