核心结论：公司公章和营业执照被他人拿走用于小额贷款，属于严重侵害公司权益的行为，公司应立即采取法律措施阻止损失扩大并追究责任。以下是具体处理步骤和法律分析：

1. 立即挂失并补办公章、营业执照

• 公章挂失：携带公司营业执照副本、法定代表人身份证、挂失声明（需加盖法人私章或签字）到公安机关备案，并登报声明公章作废。新公章需重新刻制并备案。
• 营业执照补办：通过国家企业信用信息公示系统发布遗失公告，持法定代表人身份证、补办申请书等材料到市场监管部门补办。
• 目的：防止他人继续使用公章或营业执照从事违法活动，降低后续风险。

2. 核查贷款合同效力，主张合同无效

• 无权代理问题：若拿走公章和营业执照的人非公司授权代表，其以公司名义签订的贷款合同可能构成“无权代理”。根据《民法典》第171条，公司可拒绝追认合同，合同对公司不发生效力。
• 表见代理例外：若相对方（贷款方）有理由相信行为人有代理权（如持有公章、营业执照），可能构成“表见代理”，合同可能被认定有效。此时需证明相对方未尽合理审查义务（如未核实授权文件）。
• 操作建议：立即向贷款方发出书面声明，明确否认合同效力，并要求终止放款或返还已发放款项。

3. 报警并追究刑事责任

• 罪名可能：行为人可能涉嫌“盗窃、抢夺、毁灭国家机关公文、证件、印章罪”或“伪造公司印章罪”（若私刻公章），以及“贷款诈骗罪”（若以非法占有为目的）。
• 证据收集：保存公章、营业执照遗失的报警记录、登报声明、贷款合同复印件、行为人身份信息等。
• 目的：通过刑事立案固定证据，为后续民事索赔提供支持。

4. 民事索赔：要求行为人赔偿损失

• 赔偿范围：包括因贷款产生的本金、利息、违约金、律师费、诉讼费等直接损失，以及因公章、营业执照挂失产生的费用。
• 法律依据：根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
• 操作建议：委托律师向行为人发送律师函，要求限期赔偿；若协商无果，可向法院提起侵权之诉。

5. 防范后续风险：加强内部管理

• 公章管理：建立用章登记制度，指定专人保管，每次用章需留存审批记录和用章文件复印件。
• 营业执照保管：由法定代表人或指定人员保管，避免随意出借。
• 员工教育：定期培训员工识别诈骗手段，防止内部人员与外部勾结。

总结：公司应第一时间挂失补办证件、否认贷款合同效力、报警追究刑事责任，并通过民事诉讼索赔。同时需完善内部管理，避免类似事件再次发生。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。