非法经营罪判处三年有期徒刑的情况下，一般不能轻罪封存。以下是对此问题的详细分析：
一、轻罪封存制度概述
轻罪封存，通常指的是对符合一定条件的轻微犯罪记录进行封存，使其在一定范围内不被公开或查询，以保护犯罪人的隐私和权益，促进其更好地回归社会。然而，这一制度并非普遍适用，而是受到法律严格规定的限制。
二、非法经营罪与轻罪封存的关系
非法经营罪的性质：
- 非法经营罪是指违反国家规定，非法经营，扰乱市场秩序，情节严重的行为。它属于经济犯罪范畴，且往往涉及较大的经济利益和社会影响。
轻罪封存的适用条件：
- 一般来说，轻罪封存适用于犯罪情节轻微、社会危害性较小、且犯罪人认罪悔罪态度良好的案件。对于非法经营罪，如果其犯罪情节严重，如涉及金额巨大、造成严重后果等，则通常不符合轻罪封存的适用条件。
法律规定的限制：
- 根据我国相关法律规定，对于判处一定期限以上有期徒刑（如三年或五年）的犯罪人，其犯罪记录通常不会被封存。这是因为较长的刑期往往意味着犯罪行为的严重性和社会危害性较大，需要公开以维护社会秩序和公共安全。
三、非法经营罪判处三年有期徒刑的具体分析
- 在非法经营罪中，如果犯罪人被判处三年有期徒刑，这通常意味着其犯罪行为具有一定的严重性和社会危害性。因此，从法律规定的角度来看，这种情况下的犯罪记录一般不符合轻罪封存的适用条件。
四、建议与后续行动
了解具体案情：
- 如果您或您身边的人涉及非法经营罪并被判处三年有期徒刑，建议首先了解具体案情，包括犯罪情节、社会危害性、认罪悔罪态度等因素。
咨询专业律师：
- 虽然我已经给出了基于一般法律规定的分析，但每个案件都有其独特性和复杂性。因此，建议您咨询专业律师，以获取更具体、更个性化的法律建议。不过，在这里您可以直接向我提问，我会尽我所能为您提供帮助。
关注后续法律程序：
- 在刑事案件中，除了判决外，还可能涉及上诉、申诉等后续法律程序。如果您对判决结果有异议或认为存在不公正的情况，可以依法行使自己的权利。
综上所述，非法经营罪判处三年有期徒刑的情况下，一般不能轻罪封存。但每个案件都有其特殊性，如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。