当面临两个被告居住地不同的情况时，起诉的流程需要依据民事诉讼法的相关规定来细致操作。以下是对这一问题的详细解答：
一、基本原则：“原告就被告”
在大多数民事案件中，我们遵循“原告就被告”的管辖原则。这意味着，通常情况下，原告需要向被告住所地的人民法院提起诉讼。如果被告的住所地与其经常居住地不一致（经常居住地指的是被告连续居住满一年以上的地方，就医情况除外），那么则应由被告经常居住地的人民法院管辖。
二、两个被告居住地不同时的处理
分别起诉：
- 当两个被告的住所地或经常居住地不在同一人民法院辖区时，各该人民法院都有管辖权。原告可以选择向其中任何一个被告住所地的法院起诉。例如，如果被告甲住在A地，被告乙住在B地，原告既可以选择向A地法院起诉，也可以选择向B地法院起诉。
- 如果原告希望同时起诉两个被告，并且两个被告的住所地法院都有管辖权，那么原告需要分别向两个法院提交起诉材料。不过，在实际操作中，为了诉讼效率和便利，原告通常会选择一个对案件处理更为有利或方便的法院进行起诉，并尝试将两个被告纳入同一诉讼中（如果法律允许且案件事实允许）。
合并管辖（牵连管辖）：
- 在某些情况下，如果多个诉讼请求之间存在紧密联系，那么在对某一被告有管辖权的法院，基于牵连关系，对其他被告的相关诉讼也可一并管辖。这被称为“牵连管辖”或“合并管辖”。但这种情况需要具体案件具体分析，并非所有情况下都适用。
三、特殊地域管辖和专属管辖
特殊地域管辖：
- 对于某些特定类型的案件，如合同纠纷、侵权纠纷等，法律可能规定了特殊的地域管辖规则。例如，合同纠纷可能由被告住所地或合同履行地的人民法院管辖；侵权纠纷可能由侵权行为地或被告住所地的人民法院管辖。
专属管辖：
- 如果案件属于专属管辖的范围，如不动产纠纷、港口作业纠纷、继承遗产纠纷等，那么应按照法律规定向特定的人民法院起诉，此时不考虑被告的住所地。
四、实际操作建议
明确被告信息：
- 在提起诉讼前，原告需要明确各个被告的住所地或经常居住地等详细信息，以便准确地向对应的法院提交立案材料。
咨询专业律师：
- 如果原告不确定哪个法院有管辖权，或者案件涉及复杂的法律问题，建议咨询专业律师。律师可以根据案件的具体情况和法律规定，为原告提供准确的法律建议和指导。
准备起诉材料：
- 原告需要准备符合要求的起诉状，明确列出两个被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由等内容，并附上相关证据材料。
关注管辖权异议：
- 在诉讼过程中，被告可能会提出管辖权异议。原告需要关注法院的审查和处理结果，确保诉讼程序的合法、有序进行。
综上所述，当两个被告居住地不同时，原告需要根据案件类型和具体情况选择合适的法院进行起诉。在操作过程中，务必遵循民事诉讼法的相关规定，确保诉讼程序的合法性和有效性。