农业农村局查处违法占用土地建住宅决定是否立案的时限，主要依据《中华人民共和国土地管理法》及其相关实施条例，一般土地违法案件自受理之日起，应在2个月内查处结束；对上级交办、督办的案件，自受理之日起，一般应在1个月内查处结束。以下是详细分析：
一、法律依据与查处时限
法律依据：
- 《中华人民共和国土地管理法》：该法规定了土地管理的基本原则和制度，包括土地利用规划、土地征收、土地使用权出让与转让、土地违法行为的处罚等内容。
- 《中华人民共和国土地管理法实施条例》：该条例对《土地管理法》中的相关规定进行了细化和补充，明确了土地违法行为的查处程序和时限。
查处时限：
- 根据相关法律法规及实践，土地违法案件自受理之日起，一般应在2个月内查处结束。这一时限适用于大多数土地违法案件，包括违法占用土地建住宅的情况。
- 对于上级交办、督办的案件，由于这些案件往往具有更高的紧迫性和重要性，因此自受理之日起，一般应在1个月内查处结束。如果上级有明确的时间要求，则应从其规定。
二、查处程序与要点
案件受理：
- 农业农村局或相关土地管理部门在接到群众举报、上级交办或其他部门移送的土地违法案件后，应进行初步审查，判断是否符合立案条件。
立案审查：
- 对符合立案条件的案件，应填报《土地违法案件立案呈批表》，经相关部门初审、审核批准后立案。立案后，由监察大队或相关调查机构组织调查取证。
调查取证：
- 调查过程中，应收集能证实违法行为的各种原始证据，对违法案件当事人、嫌疑犯和证人进行询问，并作好笔录；对违法案件相关现场进行勘测，作好笔录和制作现场勘测资料。
处理与执行：
- 案件调查结束后，应撰写《土地违法案件调查报告》，报相关部门审议。根据审议结果，作出行政处罚决定或其他处理决定，并负责向当事人送达相关法律文书。当事人应在规定期限内履行处罚决定，如不履行，可依法申请强制执行。
三、特殊情况与注意事项
特殊情况：
- 对于情节严重、影响恶劣的土地违法案件，或涉及多个部门、跨区域的复杂案件，查处时限可能会适当延长。但延长时限应经过合法程序，并告知当事人。
注意事项：
- 在查处过程中，应严格遵守法定程序，确保当事人的合法权益不受侵害。
- 对于查处的土地违法案件，应及时公开查处结果，接受社会监督。
建议：在实际操作中，如果遇到农业农村局查处违法占用土地建住宅的案件，可以关注其查处时限是否符合上述规定。如果认为查处时限过长或存在其他问题，可以向相关部门反映或寻求法律帮助。如果有任何法律问题，也可以直接向我咨询。