关于您提出的“借款给公司给自己发工资是否合法”的问题，这实际上涉及到了工资发放的合法性和借款协议的法律效力两个层面，下面我将为您详细分析。

首先，从形式上来看，如果员工和公司之间签订了明确的借款协议，并且该协议在签订过程中没有违反法律法规的强制性规定，比如不存在欺诈、胁迫等非法手段，那么这份借款协议在形式上是有一定法律效力的。也就是说，如果仅从协议本身来看，它似乎为以借款形式发工资提供了一定的依据。

然而，从本质上来说，工资是员工为公司提供劳动后应得的报酬，它应该通过正规的薪酬支付流程来发放。如果公司采用借款的形式来发放工资，这实际上可能掩盖了真实的工资支付关系，存在法律风险。一旦这种关系被认定为“名为借款实则为工资”，那么员工就有权主张借款协议无效，并要求公司按照正常的工资标准补发工资差额。

此外，公司采用借款形式发工资还可能引发其他潜在纠纷。比如，如果公司未来无法按时偿还“借款”，员工可能会面临无法及时收回自己应得工资的风险。同时，这种做法也可能影响公司的财务透明度和信誉度。

因此，我建议您，如果公司目前正在采用借款形式发工资，应该尽快纠正这一做法，规范工资发放流程。公司可以通过银行转账等正规方式支付工资，并保留好工资计算依据、支付凭证等相关证据。如果公司已经与员工签订了借款协议，建议尽快与员工协商，签订补充协议明确该款项的性质以及后续的处理方式，以避免潜在的法律风险。

总的来说，虽然从形式上看借款协议可能有一定效力，但以借款形式发工资存在本质上的法律风险和潜在纠纷。因此，公司应该遵守相关法律法规，通过正规渠道发放工资，以保障员工的合法权益和公司的稳健运营。