法院是否会判决对方在您的自留地上进行保温施工，取决于多个法律因素和案件具体情况，无法直接给出肯定或否定的结论。以下是从不同角度进行的分析：
一、物权保护角度
自留地使用权：
- 自留地作为您的个人财产，您享有使用权和处置权。根据《民法典》的相关规定，物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。若对方未经您同意，擅自要在您的自留地上进行保温施工，这明显侵犯了您的物权。
法院判决原则：
- 法院在判决时，会遵循物权保护原则，确保您的合法权益不受侵害。如果对方无法提供合法依据或未经您同意进行施工，法院不太可能判决其可以在您的自留地上施工。
二、合同与协议角度
调解协议效力：
- 法院调解是解决纠纷的一种方式，但调解协议需双方自愿达成并具有法律效力。如果调解未成功，说明双方未就施工问题达成一致意见，调解协议未成立。
合同约束：
- 如果对方主张有与您或相关方签订的合同，要求在您的自留地上施工，那么合同的合法性、有效性以及履行情况将成为法院判决的重要依据。若合同存在违法、无效或未履行等情形，法院不会支持对方的施工请求。
三、诉讼程序与证据角度
诉讼程序：
- 在诉讼过程中，法院会依法进行审理，包括听取双方陈述、审查证据、进行法庭调查等。法院会根据查明的事实和适用的法律作出判决。
证据重要性：
- 证据是法院判决的关键。对方需要提供充分的证据证明其有权在您的自留地上施工，如土地使用权证、施工许可、合同等。如果您能提供相反证据，如自留地使用权证、对方侵权行为的证据等，将有助于法院作出有利于您的判决。
四、可能的结果与建议
可能结果：
- 如果对方无法提供合法依据或证据不足，法院不太可能判决其可以在您的自留地上施工。
- 如果对方能提供充分证据且合同合法有效，法院可能会判决其有权施工，但会考虑您的合法权益和补偿问题。
建议：
- 收集证据：积极收集与自留地使用权、对方侵权行为相关的证据，以备诉讼之需。
- 咨询律师：在诉讼过程中，咨询专业律师的意见，了解您的权利和义务，以及可能的诉讼结果。
- 参与诉讼：积极参与诉讼过程，陈述您的观点和诉求，维护您的合法权益。
如果您在此事上有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更详细、更专业的法律建议。