针对员工入职两天便离职的情况，公司要有效规避风险，需从入职管理、离职流程、法律合规及后续跟进等多个环节进行综合考量与操作。以下是一些具体建议：
一、入职管理阶段
完善入职流程：
- 确保入职手续齐全，包括但不限于签订劳动合同、保密协议、竞业限制协议（如适用）等，明确双方权利义务。
- 对新员工进行详细的入职培训，包括公司文化、规章制度、岗位职责等，确保员工对工作环境和要求有清晰的认识。
加强背景调查：
- 在招聘过程中，对候选人的背景进行充分调查，包括工作经历、教育背景、职业操守等，以降低因信息不实带来的风险。
二、离职协商阶段（尽管员工仅入职两天，但此阶段原则同样适用）
及时沟通：
- 一旦得知员工有离职意向，应立即与其进行沟通，了解离职原因，并尝试解决问题或提供改进建议。
- 若员工坚持离职，应明确告知离职流程和相关手续。
书面记录：
- 要求员工以书面形式提交离职申请，注明离职原因和预计离职日期，以便后续处理。
- 进行离职面谈，并书面记录面谈内容，由员工签字确认，以避免后续争议。
三、工作交接阶段（针对短期入职员工，可简化但不可省略）
明确交接内容：
- 尽管员工仅入职两天，但仍需明确其接触的工作内容、文件资料、办公用品等，并制定交接清单。
- 指定监交人员监督交接过程，确保交接全面准确。
保护商业秘密：
- 强调保密义务，即使员工入职时间短，也可能接触到公司敏感信息。
- 要求员工返还所有涉密资料和物品，并进行保密培训。
四、离职手续办理阶段
及时办理社保与档案转移：
- 按规定时间办理社保减员手续，并告知员工社保转移事宜。
- 妥善处理员工档案转移，确保档案资料完整准确。
结清薪资与费用：
- 核算离职当月薪资，并按规定时间支付。
- 及时处理员工的费用报销申请（如有）。
规范离职证明出具：
- 出具解除劳动关系的证明，并通过邮寄等方式及时给员工寄出，留存相关凭证。
五、后续阶段
法律风险监控：
- 密切关注离职员工是否提起劳动仲裁或诉讼，及时收集证据并做好应对准备。
- 定期向专业律师咨询劳动法律法规变化，确保离职管理工作符合法律要求。
提升员工归属感和职业发展（长期策略）：
- 通过优化招聘流程、提供职业发展规划、培训机会等方式，提高员工的归属感和满意度，减少短期离职情况。
- 营造融洽的工作环境，鼓励员工参与决策，提供个人事业发展空间。
综上所述，公司应通过完善入职管理、离职协商、工作交接、离职手续办理及后续跟进等全流程措施，有效规避因员工短期离职而带来的各种风险。