医疗机构未凭医师处方销售药品，主要会面临“责令限期改正”的处罚；若逾期不改正，则会启动进一步的行政处罚程序。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与处罚原则

根据《中华人民共和国药品管理法》以及《药品经营和使用质量监督管理办法》的相关规定，处方药的销售必须凭执业医师或执业助理医师开具的处方。这是为了保障药品的合理使用和公众的健康安全。对于未凭处方销售处方药的行为，法律明确规定了相应的处罚措施。

二、具体处罚措施

1. 责令限期改正：

   • 当发现医疗机构未凭处方销售药品时，监管部门首先会责令其限期改正。这一措施的目的是要求医疗机构在规定的时间内纠正其违法行为，恢复合法状态。
   • “责令限期改正”的期限通常不超过30日，监管部门会在期限内进行复查，以确保医疗机构已经改正了其违法行为。

2. 逾期不改正的处罚：

   • 如果医疗机构在“责令限期改正”的期限内未改正其违法行为，或者复查后发现再次出现相同违法行为，监管部门将启动进一步的行政处罚程序。
   • 具体的行政处罚措施可能包括罚款、吊销药品经营许可证等，具体取决于违法行为的严重程度和监管部门的裁量。

三、执法难点与对策建议

在执法过程中，监管部门可能会遇到一些难点，如医疗机构利用时间差进行“打擦边球”式的违规操作，或者屡改屡犯的恶性循环。针对这些问题，有观点认为应将“责令限期改正”理解为要求医疗机构建立并维持持续合法的经营状态，一旦在改正期后再次查获相同违法行为，即应视为“逾期未改正”，并据此适用相应罚则。然而，也有观点认为这种扩张解释可能增加医疗机构的法定义务负担，缺乏明确法律依据。

从实践角度来看，更可行的做法是通过完善现有制度框架或创新监管手段来提高治理效率。例如：

• 深化“医保药监”协同机制，加强部门联动，推动监管信息与执法结果的互认共享与协同应用。
• 拓宽社会共治渠道，构建多元参与的监督网络，如畅通举报渠道、强化行业协会的自律引导作用等。

四、法律建议

对于医疗机构而言，为了避免未凭处方销售药品带来的法律风险，应当严格遵守相关法律法规，确保处方药的销售必须凭执业医师或执业助理医师开具的处方。同时，医疗机构也应加强内部管理，提高员工的法律意识和合规意识，确保各项经营活动都在法律框架内进行。

若您在医疗纠纷、医疗事故赔偿等领域遇到法律问题，欢迎直接向我咨询。我将运用我的专业知识和经验，为您提供全面、准确的法律建议。